75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1200 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1200  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000134873  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1427  hypothetical protein  97.1 
 
 
97 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0167884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0185  hypothetical protein  40.68 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431442  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0050  addiction module killer protein  44.07 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3745  addiction module killer protein  40 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117851  hitchhiker  0.00174099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0367  addiction module killer protein  44.26 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.247793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0236  addiction module killer protein  40.98 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3001  addiction module killer protein  39.68 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0607  addiction module killer protein  37.93 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0570  addiction module killer protein  38.24 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  unclonable  0.00000000000132448  unclonable  2.98787e-21 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3599  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164625  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0855  addiction module killer protein  40.98 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503668  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3921  addiction module killer protein  33.33 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315086  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4036  addiction module killer protein  38.98 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2516  hypothetical protein  34.78 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.726824  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2008  hypothetical protein  38.1 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5334  hypothetical protein  37.68 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723187  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2671  hypothetical protein  40.68 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3154  addiction module killer protein  42.37 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429668  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0419  hypothetical protein  40.98 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.366932  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3503  addiction module killer protein  37.68 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.149451  hitchhiker  0.00969032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4469  hypothetical protein  38.98 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1302  addiction module killer protein  39.68 
 
 
112 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0172  addiction module killer protein  45.76 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916333  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0899  addiction module killer protein  38.6 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1183  hypothetical protein  32.79 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18062  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4138  hypothetical protein  32.79 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0172764  normal  0.111049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3122  hypothetical protein  36.07 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2533  hypothetical protein  38.71 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000474289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4017  hypothetical protein  36.21 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8269  addiction module killer protein  37.93 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194328  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4951  addiction module killer protein  34.48 
 
 
105 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2536  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2958  hypothetical protein  33.9 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  0.740348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36110  hypothetical protein  31.75 
 
 
111 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1221  addiction module killer protein  41.07 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.958057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1687  addiction module killer protein  33.33 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40600  hypothetical protein  37.93 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0016  probable addiction module killer protein  37.7 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0225  hypothetical protein  38.98 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4221  hypothetical protein  32.79 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2122  addiction module killer protein  31.75 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1253  addiction module killer protein  38.98 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2823  addiction module killer protein  42.86 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.299861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0457  hypothetical protein  35.59 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0568  hypothetical protein  38.6 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4762  addiction module killer protein  37.7 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4948  addiction module killer protein  40.35 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583991  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4242  addiction module killer protein  39.34 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6940  hypothetical protein  33.93 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112291  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6456  addiction module killer protein  36.51 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4549  addiction module killer protein  34.48 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3175  addiction module killer protein  39.34 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0450  hypothetical protein  33.9 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0387  prophage protein gp49  44.9 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0215014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1444  hypothetical protein  33.9 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1798  hypothetical cytosolic protein  44.9 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0569  addiction module killer protein  37.5 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.443198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2313  hypothetical protein  34.55 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3742  addiction module killer protein  33.93 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3673  addiction module killer protein  34.55 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5374  hypothetical protein  29.51 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000336277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0862  hypothetical protein  34.48 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.622779  normal  0.178504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3988  hypothetical protein  41.67 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6312  addiction module killer protein  34.48 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0289736  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4612  addiction module killer protein  37.7 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0041  addiction module killer protein  32.35 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0684  hypothetical protein  37.68 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00337855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0084  hypothetical protein  47.5 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.033356  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3781  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.519742  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4582  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.213587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1307  hypothetical protein  37.04 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000276635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2208  addiction module killer protein  30.51 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.63367  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0501  hypothetical protein  34.62 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5508  hypothetical protein  32.73 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>