More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1132 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  100 
 
 		 446 aa  893    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  66.44 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  51.12 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  35.09 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  29.29 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  26.24 
 
 		 546 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  28.76 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  26.45 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 495 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  26.24 
 
 		 547 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  26.24 
 
 		 495 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  26.24 
 
 		 547 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  26.24 
 
 		 546 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  26.24 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  27.14 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  27.75 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  26.8 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  27.13 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  27.13 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  26.91 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  27.11 
 
 		 502 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  27.15 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  28.28 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.73 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.29 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.73 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  26.77 
 
 		 439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.73 
 
 		 464 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  27.5 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  26.58 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  26.67 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.07 
 
 		 450 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.62 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.06 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  25.4 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  24.94 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  22.2 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  24.83 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  24.06 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  25.68 
 
 		 438 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.08 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2404  hypothetical protein  25.18 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.146193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  25.98 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  23.01 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1856  Na+-driven multidrug efflux pump  24.39 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0920105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 467 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  23.35 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.41 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  23.37 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.58 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  24.55 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  23.2 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  22.46 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  25.55 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  22.55 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  23.57 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  27.03 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  23.9 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  21.96 
 
 		 538 aa  100  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  22.63 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  21.25 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  22.69 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  23.13 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  23.75 
 
 		 453 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  25.86 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  21.03 
 
 		 467 aa  95.1  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  24.01 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.5 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 486 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 450 aa  93.6  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.77 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  22.53 
 
 		 455 aa  93.6  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  24.63 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  23.11 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  24.31 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.76 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  24.22 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>