More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1096 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 270 aa  551  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  78.31 
 
 		 295 aa  454  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  76.75 
 
 		 262 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  68.9 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  61.75 
 
 		 278 aa  357  9e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  60.52 
 
 		 244 aa  322  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  56.46 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  56.83 
 
 		 246 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  56.46 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  55.68 
 
 		 264 aa  292  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1915  hydrogenase accessory protein HypB  53.82 
 
 		 281 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.228802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  52.4 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1430  hydrogenase accessory protein HypB  53.33 
 
 		 266 aa  287  1e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  53.79 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2043  hydrogenase accessory protein HypB  51.1 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1908  hydrogenase accessory protein HypB  54.24 
 
 		 277 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.121577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1836  hydrogenase accessory protein HypB  53.03 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1816  hydrogenase accessory protein HypB  53.99 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2027  hydrogenase accessory protein HypB  51.69 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2411  hydrogenase accessory protein HypB  52.16 
 
 		 285 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0449174  decreased coverage  0.00000969961 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2161  hydrogenase accessory protein HypB  53.23 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  51.89 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1871  hydrogenase accessory protein HypB  53.61 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1883  hydrogenase accessory protein HypB  52.19 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1759  hydrogenase accessory protein HypB  58.33 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2109  hydrogenase accessory protein HypB  48.88 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432968  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  55.45 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  55.5 
 
 		 296 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  51.14 
 
 		 268 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  45.15 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  45.36 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  42.18 
 
 		 326 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  44.28 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  43.01 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  49.77 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  43.32 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  44.65 
 
 		 283 aa  221  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  44.94 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  46.54 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  49.1 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  42.38 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  42.66 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  42.64 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  41.79 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  41.67 
 
 		 293 aa  214  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  51.18 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  42.4 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  42.4 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00350  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  45.32 
 
 		 308 aa  212  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  44.93 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  49.06 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  49.06 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.07 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  39.94 
 
 		 319 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  49.09 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  44.62 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  45 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2445  hydrogenase accessory protein HypB  40.21 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  49.03 
 
 		 224 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  41.64 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.07 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  49.52 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  45.81 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  50.71 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  49.52 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1417  hydrogenase accessory protein HypB  45.87 
 
 		 394 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.78 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0101113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.78 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03880  hydrogenase accessory protein HypB  48.58 
 
 		 215 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  41.26 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.78 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.75 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.78 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  46.45 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 217 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  39.85 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  48.31 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  44.93 
 
 		 303 aa  205  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  39.85 
 
 		 267 aa  205  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.41 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  47.14 
 
 		 225 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  42.81 
 
 		 288 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  49.76 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1160  hydrogenase accessory protein HypB  43.67 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  43.02 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.75 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  40.14 
 
 		 305 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  47.52 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  46.33 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.44 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.591749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>