54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1076 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1076  DNA gyrase subunit A  100 
 
 		 671 aa  1385    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000909041  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1855  NLP/P60  70.49 
 
 		 657 aa  1010    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0572  NLP/P60  48.82 
 
 		 646 aa  620  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.126313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1417  NLP/P60 protein  41.39 
 
 		 666 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0940  NLP/P60  39.28 
 
 		 421 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1169  putative lipoprotein  37.56 
 
 		 444 aa  296  8e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1024  putative lipoprotein  37.1 
 
 		 448 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0970  putative lipoprotein  37.1 
 
 		 448 aa  293  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1095  NLP/P60  30.96 
 
 		 442 aa  246  9e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.18265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2861  NLP/P60 protein  31.62 
 
 		 459 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2724  NLP/P60 family lipoprotein  28.07 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0991  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000170293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1403  NLP/P60 protein  32.06 
 
 		 484 aa  200  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2886  hypothetical protein  44.1 
 
 		 248 aa  190  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0811534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2088  NLP/P60 protein  30.13 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.1938  normal  0.0662136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2458  hypothetical protein  32.47 
 
 		 452 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0157952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1599  NLP/P60 protein  30.38 
 
 		 459 aa  178  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0770997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1397  NLP/P60 protein  30.65 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1274  NLP/P60 protein  32.47 
 
 		 531 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.222916 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0507  NLP/P60 protein  30.06 
 
 		 399 aa  172  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3276  putative cell wall-associated hydrolase protein  31.37 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2102  putative cell wall-associated hydrolase  32.74 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00192881  hitchhiker  5.08057e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2095  putative cell wall-associated hydrolase  32.74 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000538465  hitchhiker  0.000775655 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2155  putative cell wall-associated hydrolase  33.04 
 
 		 478 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277397  hitchhiker  0.00000000000022034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1181  putative cell wall-associated hydrolase  32.74 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000015464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1304  putative cell wall-associated hydrolase  31.85 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258474  hitchhiker  0.00000040862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1811  hypothetical protein  35.98 
 
 		 263 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1881  NlpC-P60 family protein  29.33 
 
 		 532 aa  134  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.171473  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1440  hypothetical protein  36.14 
 
 		 280 aa  133  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1400  hypothetical protein  42.31 
 
 		 351 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0626  NLP/P60 protein  30 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0476  NLP/P60 protein  25.09 
 
 		 459 aa  96.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4171  NLP/P60  24.4 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0079177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04246  NlpC/P60 family protein  26.5 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0340  NLP/P60 protein  28.37 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2612  hypothetical protein  38.33 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1043  hypothetical protein  40.59 
 
 		 364 aa  77  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0128  hypothetical protein  38.03 
 
 		 435 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1633  hypothetical protein  37.5 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.631294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6627  NLP/P60 protein  25.17 
 
 		 1101 aa  57.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.813247  hitchhiker  0.000190725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0045  hypothetical protein  31.87 
 
 		 324 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3058  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  33.78 
 
 		 179 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  32.29 
 
 		 170 aa  51.2  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2781  hypothetical protein  31.07 
 
 		 246 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3017  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B protein  27.98 
 
 		 168 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1540  hypothetical protein  27.78 
 
 		 257 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05800  hypothetical protein  32.26 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.97 
 
 		 261 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6086  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.96 
 
 		 260 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  44.9 
 
 		 269 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0828  hypothetical protein  30.34 
 
 		 292 aa  45.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3317  hypothetical protein  28.47 
 
 		 254 aa  45.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1183  hypothetical protein  32.91 
 
 		 166 aa  44.3  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.95 
 
 		 667 aa  43.9  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>