119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1075 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  70.16 
 
 
438 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  896    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0573  TPR domain-containing protein  53.35 
 
 
435 aa  457  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.526626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0941  TPR domain-containing protein  47.63 
 
 
445 aa  421  1e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.994783  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1416  hypothetical protein  44.24 
 
 
442 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0522  conserved hypothetical protein, possible helicase  46.88 
 
 
420 aa  359  4e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1023  hypothetical protein  44.12 
 
 
447 aa  354  2e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0969  hypothetical protein  44.12 
 
 
447 aa  354  2e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  39.4 
 
 
422 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0257  AAA ATPase  30.79 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.166241  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2047  helicase, putative  27.77 
 
 
761 aa  170  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  31.99 
 
 
829 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1080  hypothetical protein  29.08 
 
 
485 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0999  AAA ATPase  29.02 
 
 
759 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  29.55 
 
 
680 aa  155  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3066  AAA ATPase  30.3 
 
 
438 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  28.35 
 
 
734 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  29.83 
 
 
764 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3653  helicase-related protein  26.17 
 
 
738 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0527  AAA ATPase  27.61 
 
 
517 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  27.84 
 
 
639 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5152  AAA ATPase  27.58 
 
 
779 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.430692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0815  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member-like protein  30.27 
 
 
614 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0861  ATPas  28.7 
 
 
782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0878  AAA ATPase  28.7 
 
 
782 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0867  AAA ATPase  28.47 
 
 
782 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1164  hypothetical protein  28.6 
 
 
445 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1180  AAA ATPase  26.85 
 
 
782 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247835  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2564  hypothetical protein  28.7 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.507022  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02830  DNA repair and recombination protein pif1, mitochondrial precursor, putative  27.66 
 
 
669 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.577209  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  26.24 
 
 
691 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1901  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) subunit alpha  26.22 
 
 
472 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2072  TPR domain-containing protein  23.79 
 
 
493 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1560  AAA ATPase  28.67 
 
 
659 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170714  unclonable  0.00000000068929 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1460  hypothetical protein  55.56 
 
 
100 aa  106  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.967718  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06895  helicase (Eurofung)  26.2 
 
 
661 aa  97.1  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1611  DNA helicase: AAA ATPase  29.86 
 
 
653 aa  96.7  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.77045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1843  ATPase  30.07 
 
 
646 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15917  predicted protein  24.75 
 
 
628 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  23.54 
 
 
742 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  23.76 
 
 
750 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  24.94 
 
 
881 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12091  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  30.91 
 
 
567 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2955  hypothetical protein  24.32 
 
 
488 aa  56.6  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0703173  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  25.53 
 
 
750 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  23.36 
 
 
744 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  23.88 
 
 
952 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  23.57 
 
 
952 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  28.78 
 
 
641 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  23.7 
 
 
879 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  26.91 
 
 
698 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  32.35 
 
 
726 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  24.58 
 
 
728 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1113  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.73 
 
 
566 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.327644  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0744  hypothetical protein  34.83 
 
 
130 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.762104  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.76 
 
 
698 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  30.94 
 
 
733 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  31.85 
 
 
733 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  22.32 
 
 
907 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  29.71 
 
 
731 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  31.85 
 
 
733 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  31.85 
 
 
727 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  21.5 
 
 
740 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_002620  TC0021  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative  30.83 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  33.09 
 
 
736 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  26.65 
 
 
740 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2849  AAA ATPase  27.33 
 
 
678 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0353435  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11931  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  26.83 
 
 
563 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.271805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2487  putative deoxyribonuclease  22.08 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4249  putative deoxyribonuclease  21.78 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  22.92 
 
 
710 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  28.57 
 
 
728 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10593  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit - helicase superfamily I member  27.66 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  22.45 
 
 
731 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  22.5 
 
 
754 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  30.82 
 
 
738 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  30 
 
 
740 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  25.29 
 
 
914 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  30.53 
 
 
688 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5077  putative deoxyribonuclease  22.11 
 
 
365 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2665  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V)  25.85 
 
 
474 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  30.82 
 
 
728 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11171  exodeoxyribonuclease V  25.83 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  31.01 
 
 
744 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.03 
 
 
732 aa  46.2  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  20.19 
 
 
1175 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  22.76 
 
 
788 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09351  exodeoxyribonuclease V  23.43 
 
 
491 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0674  putative deoxyribonuclease  32.26 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.663725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.25 
 
 
747 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0685  putative deoxyribonuclease  32.26 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  23.75 
 
 
711 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  24.06 
 
 
724 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  33.58 
 
 
746 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  29.79 
 
 
725 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  21.8 
 
 
1168 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  28.57 
 
 
659 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.06 
 
 
1538 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  24.13 
 
 
902 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0521  ATP-dependent exodeoxyribonuclease  27.21 
 
 
473 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>