163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1012 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  64.55 
 
 
300 aa  391  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  53.36 
 
 
308 aa  331  7.000000000000001e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  54.15 
 
 
303 aa  317  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  51.52 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  50.51 
 
 
300 aa  301  8.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 
300 aa  301  9e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
300 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  46.31 
 
 
303 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  44.03 
 
 
300 aa  248  8e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  43 
 
 
310 aa  244  9e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.2 
 
 
680 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  35.09 
 
 
313 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 
330 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
310 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  32.79 
 
 
319 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  36.16 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 
332 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
312 aa  136  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  30.55 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
320 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  29.77 
 
 
313 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.03 
 
 
312 aa  125  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 
364 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 
295 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
313 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 
321 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  32.3 
 
 
365 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  28.53 
 
 
326 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  31.95 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  30.32 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.17 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
320 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
267 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
266 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 
308 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 
313 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
323 aa  105  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
311 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  24.52 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 
365 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  23.13 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  23.65 
 
 
341 aa  56.2  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.99 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.4 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.15 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 
345 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.61 
 
 
298 aa  52.4  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.94 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4564  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.94 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4751  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.48 
 
 
356 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.94 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.112762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.5 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10886  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.27 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6033000000000002e-27  normal  0.157958 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  26.54 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0923  hypothetical protein  34.67 
 
 
77 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000601668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5047  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.37 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735046  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  24.05 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.01 
 
 
356 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  26.28 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0061  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
421 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000135006  hitchhiker  0.00291545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.31 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2288  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.44 
 
 
375 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.67 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.79 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2919  Fe-S oxidoreductases  29.44 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  26.23 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.47 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  24.42 
 
 
330 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 
337 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
574 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.2 
 
 
335 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.6 
 
 
375 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.27 
 
 
351 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  32.81 
 
 
333 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3299  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.82 
 
 
347 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1282  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.591085  normal  0.574415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>