More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1008 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  71.69 
 
 		 217 aa  332  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  32.99 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.18 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  30.63 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.15 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.34 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 226 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  27.5 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  29.79 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>