88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0951 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 		 590 aa  1197    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  43.71 
 
 		 638 aa  234  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.26 
 
 		 585 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  36.22 
 
 		 705 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.93 
 
 		 683 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.67 
 
 		 743 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.15 
 
 		 732 aa  143  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.1 
 
 		 754 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  32.04 
 
 		 899 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  29.9 
 
 		 743 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.18 
 
 		 568 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.45 
 
 		 765 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.52 
 
 		 530 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  32.26 
 
 		 609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  32.26 
 
 		 609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.53 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.03 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  33.68 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  33.68 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  30.99 
 
 		 999 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.04 
 
 		 421 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.58 
 
 		 805 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  30.95 
 
 		 741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  32.35 
 
 		 587 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.31 
 
 		 626 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.49 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  28.13 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  26.12 
 
 		 700 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  32.52 
 
 		 810 aa  124  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.83 
 
 		 822 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  30.22 
 
 		 853 aa  124  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  32.17 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  30.07 
 
 		 629 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  28.15 
 
 		 539 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  38.42 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  31.29 
 
 		 851 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  28.81 
 
 		 678 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.74 
 
 		 603 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.62 
 
 		 698 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  31.25 
 
 		 412 aa  103  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  27.99 
 
 		 597 aa  102  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  27.8 
 
 		 685 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  27.41 
 
 		 691 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  28.52 
 
 		 450 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  28.89 
 
 		 498 aa  96.7  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.51 
 
 		 481 aa  93.6  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  28.15 
 
 		 653 aa  90.1  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  30.29 
 
 		 845 aa  89.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  27.34 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.64 
 
 		 685 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  25.9 
 
 		 303 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  28.76 
 
 		 696 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.51 
 
 		 603 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  31.37 
 
 		 662 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.91 
 
 		 605 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.44 
 
 		 723 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  29.68 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  26.17 
 
 		 862 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  29.33 
 
 		 687 aa  80.9  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.62 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  28.51 
 
 		 834 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  30.48 
 
 		 900 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.63 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.09 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  27.62 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  28.43 
 
 		 352 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  29.05 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  28.12 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  28.91 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  24.7 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.48 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  33.33 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.32 
 
 		 410 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0700  ATPase  22.82 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1597  ATPase  22.82 
 
 		 714 aa  60.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0251124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  25.7 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.97 
 
 		 651 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.62 
 
 		 748 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  30.06 
 
 		 583 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  23.95 
 
 		 524 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  22.22 
 
 		 914 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  21.88 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.41 
 
 		 559 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.7 
 
 		 559 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  22.73 
 
 		 668 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  24.12 
 
 		 847 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  24.12 
 
 		 843 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>