More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0943 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  80.8 
 
 
276 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  60.7 
 
 
276 aa  338  8e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  60.31 
 
 
276 aa  329  3e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  55.8 
 
 
275 aa  298  7e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  55.8 
 
 
275 aa  295  6e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  55.8 
 
 
275 aa  293  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  49.64 
 
 
276 aa  286  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  51.81 
 
 
275 aa  275  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  50.58 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  37.99 
 
 
284 aa  211  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  38.13 
 
 
282 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  37.45 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
285 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  37.82 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  38.43 
 
 
285 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 
294 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  40 
 
 
280 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  34.53 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  35 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
292 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
319 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 
292 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  34.9 
 
 
293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.13 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.45 
 
 
742 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 
299 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.14 
 
 
292 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.51 
 
 
780 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
293 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.43 
 
 
311 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 
313 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
290 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.39 
 
 
770 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
286 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 
302 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 
291 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
367 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
286 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.47 
 
 
312 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.88 
 
 
318 aa  148  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.16 
 
 
298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 
534 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 
293 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 
298 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.25 
 
 
319 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  30.82 
 
 
320 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.04 
 
 
778 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.68 
 
 
286 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  30.47 
 
 
313 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 
285 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 
364 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.75 
 
 
321 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 
311 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 
311 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.39 
 
 
321 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 
288 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 
293 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.71 
 
 
311 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.64 
 
 
748 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.07 
 
 
746 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.64 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.43 
 
 
746 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.75 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.71 
 
 
746 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 
290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.01 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.01 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.36 
 
 
735 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.39 
 
 
311 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30 
 
 
746 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  32.13 
 
 
302 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  30.71 
 
 
535 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 
366 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 
288 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.42 
 
 
301 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  32.05 
 
 
296 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.45 
 
 
312 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  31.2 
 
 
298 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.88 
 
 
311 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 
286 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 
310 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.32 
 
 
314 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.18 
 
 
313 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.64 
 
 
746 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
286 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  31.83 
 
 
366 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 
367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.65 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  31.83 
 
 
378 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  31.83 
 
 
366 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30 
 
 
746 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  31.49 
 
 
366 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  29.77 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.4 
 
 
750 aa  135  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.5 
 
 
313 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>