19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0930 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0930  DNA polymerase III subunit alpha  100 
 
 
237 aa  482  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1358  hypothetical protein  89.52 
 
 
399 aa  410  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219209  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0051  hypothetical protein  38.96 
 
 
330 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1355  hypothetical protein  35.19 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0127  flagellar basal-body rod protein FlgG (Distal rod protein)  33.91 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.912909  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0835  hypothetical protein  34.21 
 
 
444 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.334407  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0929  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  35.85 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0905  hypothetical protein  37.38 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0740  hypothetical protein  34.51 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.530729  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0815  hypothetical protein  36.89 
 
 
424 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272305  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0885  hypothetical protein  33.63 
 
 
434 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0157  hypothetical protein  36.45 
 
 
417 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0936  hypothetical protein  29.31 
 
 
382 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1362  hypothetical protein  32.14 
 
 
380 aa  62  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0822479  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0472  hypothetical protein  30.17 
 
 
360 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.446039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0904  hypothetical protein  96.55 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1772  hypothetical protein  28.32 
 
 
332 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1485  hypothetical protein  20.57 
 
 
381 aa  46.2  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0267  hypothetical protein  20.93 
 
 
388 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>