35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0912 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 
140 aa  266  5.9999999999999995e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  80.71 
 
 
140 aa  218  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  52.14 
 
 
140 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  44.29 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  40 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.68 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.35 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  41.35 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.43 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.86 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  26.5 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  26.5 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.91 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  32.32 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  28.8 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  31.46 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  28.8 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.23 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0333  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.59 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.613666  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  26.61 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 
175 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.81 
 
 
153 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  27.2 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.13 
 
 
259 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.6 
 
 
181 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  29.49 
 
 
164 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32 
 
 
162 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.23 
 
 
164 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.36 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.56 
 
 
143 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.56 
 
 
143 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  22.83 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf043  ATP synthase B chain  32.1 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  26.83 
 
 
141 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 
179 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>