19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0871 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  56.13 
 
 
155 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0988  hypothetical protein  33.12 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1137  hypothetical protein  32.9 
 
 
148 aa  87  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0904  hypothetical protein  33.12 
 
 
150 aa  87  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000194814  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0035  putative periplasmic protein  41.88 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0918  hypothetical protein  31.85 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000461903  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0479  putative periplasmic protein  40.2 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0986  hypothetical protein  31.09 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  30.56 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0916  hypothetical protein  30.25 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000183143  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0095  hypothetical protein  30.61 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  33.68 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1562  hypothetical protein  23.78 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0130352  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4486  hypothetical protein  24.78 
 
 
161 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2200  hypothetical protein  24.78 
 
 
150 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2213  hypothetical protein  24.78 
 
 
150 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1960  hypothetical protein  22.96 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>