61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0857 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  57.89 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  54.93 
 
 		 71 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  49.28 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  48.53 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  45.71 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  49.28 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  50.75 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  46.48 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  53.62 
 
 		 68 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  48.48 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  48.48 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.25 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  46.38 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  47.76 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  42.03 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.25 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.25 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  49.25 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.28 
 
 		 67 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.38 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.97 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  46.38 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  46.27 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  40.3 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.25 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  42.03 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  39.13 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  43.48 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  46.27 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  43.08 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  46.27 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  40.85 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.21 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  35.06 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  34.72 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  37.14 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  32 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  32.86 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  32.39 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.33 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  30.77 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  34.78 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  34.38 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  42.19 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  35.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  24.64 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1403  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  32.84 
 
 		 68 aa  42  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  34.33 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  41.94 
 
 		 64 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.06 
 
 		 63 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.06 
 
 		 63 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>