More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0825 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  100 
 
 		 272 aa  570  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  55.27 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  55.84 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  52.43 
 
 		 275 aa  278  6e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  52.38 
 
 		 280 aa  271  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  48.5 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  47.04 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  49.03 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  45.93 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  47.41 
 
 		 279 aa  260  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 276 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  46.47 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.69 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  46.1 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 450 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 416 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 416 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 416 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  45.29 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 343 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 416 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  48.94 
 
 		 271 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  44.79 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  45.21 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  45.21 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  45.53 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  44.83 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  45.75 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  43.63 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  45.63 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  42.75 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  42.37 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  38.6 
 
 		 350 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  25.75 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  28.04 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  28.09 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  25.75 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.11 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  27.44 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  25.36 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  26.32 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  26.2 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  29.46 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  24.23 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.86 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  32.87 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  28.8 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  27.23 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  26.39 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  25.46 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  25.27 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  29.12 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  29.38 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  27.34 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  30.29 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  22.9 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  27.8 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  30.49 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  26.88 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  22.57 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  28.5 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  25.2 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  22.96 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  28.74 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  26.16 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  26.17 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  29.89 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30.06 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  22.88 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  24.91 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  25.56 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  25 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  24.7 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  27.43 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  27.8 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  26.94 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  27.8 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  28.16 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  28.15 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  23.46 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  27.42 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  26.88 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  27.42 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  24.54 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  29.57 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  23.97 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  25.78 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  24.18 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  27.91 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  26.78 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 612 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  24.08 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  24.64 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>