More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0776 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  100 
 
 
173 aa  343  5e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  82.04 
 
 
174 aa  278  3e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  66.06 
 
 
177 aa  210  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  63.41 
 
 
184 aa  199  2e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  59.28 
 
 
170 aa  195  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  45.18 
 
 
165 aa  139  1e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0495  shikimate kinase  52.1 
 
 
171 aa  136  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  45.18 
 
 
165 aa  133  1e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  44.19 
 
 
165 aa  132  2e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  44.19 
 
 
165 aa  131  4e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  39.16 
 
 
166 aa  104  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  37.65 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  36.26 
 
 
173 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  42.38 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  36.42 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  35.06 
 
 
195 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  38.89 
 
 
495 aa  92.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  33.93 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  35.84 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  34.12 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  35.84 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  39.77 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  35.63 
 
 
169 aa  88.6  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  39.77 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  35.26 
 
 
171 aa  88.2  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  31.95 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  35.8 
 
 
192 aa  87.8  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  35.71 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  35.5 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  31.32 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  33.71 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  35.06 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2437  shikimate kinase  36.09 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  34.52 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  32.22 
 
 
175 aa  85.1  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  32 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  35.12 
 
 
172 aa  84.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2609  shikimate kinase  30.23 
 
 
182 aa  84  1e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0706478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  36.9 
 
 
168 aa  84  1e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1308  shikimate kinase  35.47 
 
 
172 aa  83.2  1e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0211808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  35.71 
 
 
172 aa  84  1e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  34.68 
 
 
188 aa  82.4  2e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  31.55 
 
 
168 aa  83.2  2e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  34.52 
 
 
172 aa  82.4  3e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  33.72 
 
 
170 aa  82.4  3e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  32.54 
 
 
172 aa  82.4  3e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  31.76 
 
 
179 aa  82  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  31.74 
 
 
185 aa  82  4e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  31.76 
 
 
179 aa  82  4e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  31.43 
 
 
190 aa  81.6  4e-15  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  33.73 
 
 
166 aa  81.3  6e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  33.12 
 
 
179 aa  81.3  6e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  32.14 
 
 
170 aa  80.9  9e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  33.12 
 
 
183 aa  80.5  1e-14  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  33.93 
 
 
172 aa  80.5  1e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  36.49 
 
 
170 aa  80.1  1e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  35.5 
 
 
172 aa  80.1  1e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  33.93 
 
 
172 aa  80.5  1e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  32.76 
 
 
184 aa  79.3  2e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.31404e-15 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  37.34 
 
 
161 aa  80.1  2e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  33.33 
 
 
165 aa  79.3  2e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  33.33 
 
 
165 aa  79.7  2e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  34.12 
 
 
172 aa  79.7  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  32.74 
 
 
172 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1330  Shikimate kinase  33.53 
 
 
219 aa  79.3  2e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0593402  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  33.12 
 
 
199 aa  79.3  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  34.1 
 
 
176 aa  79.3  2e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  33.12 
 
 
184 aa  79  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  33.12 
 
 
209 aa  79  3e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  31.55 
 
 
180 aa  79  3e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  34.66 
 
 
171 aa  79  3e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  29.31 
 
 
182 aa  79.3  3e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  31.28 
 
 
179 aa  79  3e-14  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  33.93 
 
 
171 aa  78.6  4e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.1554e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  34.19 
 
 
177 aa  78.6  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0696  shikimate kinase  32.94 
 
 
163 aa  78.6  4e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  34.38 
 
 
184 aa  78.6  4e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  34.19 
 
 
177 aa  78.6  4e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  34.19 
 
 
177 aa  78.6  4e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  34.19 
 
 
177 aa  78.6  4e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0683  shikimate kinase  29.76 
 
 
196 aa  78.6  4e-14  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.47245  normal  0.517024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  31.98 
 
 
170 aa  79  4e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  34.19 
 
 
177 aa  78.6  4e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  33.93 
 
 
171 aa  78.6  4e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.17623e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  32.74 
 
 
172 aa  78.6  5e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1906  shikimate kinase  35.15 
 
 
162 aa  78.6  5e-14  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0731  shikimate kinase  33.13 
 
 
170 aa  78.2  5e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000355155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  33.14 
 
 
190 aa  78.2  5e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3113  shikimate kinase II  29.59 
 
 
173 aa  78.2  5e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  32.34 
 
 
458 aa  78.2  5e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  34.52 
 
 
171 aa  78.2  6e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  31.28 
 
 
179 aa  77.8  6e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  34.29 
 
 
593 aa  78.2  6e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  34.52 
 
 
171 aa  78.2  6e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  34.52 
 
 
171 aa  78.2  6e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.34252e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  33.14 
 
 
172 aa  77.8  6e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  31.55 
 
 
189 aa  77.8  7e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  32.54 
 
 
177 aa  77.8  7e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  32.74 
 
 
165 aa  77.4  8e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  32.74 
 
 
171 aa  77.8  8e-14  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.02686e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>