17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0745 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0745  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000567772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 923 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.35 
 
 		 782 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1025 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 		 985 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  27.94 
 
 		 807 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  32.71 
 
 		 493 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1157  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.07 
 
 		 1007 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1550 aa  46.6  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 344 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.72 
 
 		 2145 aa  43.9  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.82 
 
 		 868 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3995  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 658 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 991 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  31.15 
 
 		 1145 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 650 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  27.18 
 
 		 689 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>