161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0659 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
322 aa  660    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  73.04 
 
 
348 aa  497  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  65.62 
 
 
325 aa  423  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  63.86 
 
 
323 aa  424  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  61.37 
 
 
325 aa  420  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  60.75 
 
 
325 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  60.12 
 
 
325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  52.65 
 
 
322 aa  372  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  49.38 
 
 
330 aa  308  9e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  44.86 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  42.69 
 
 
341 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  42.18 
 
 
356 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  44.21 
 
 
351 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  43.64 
 
 
355 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  42.34 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  42.22 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  42.9 
 
 
344 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  42.94 
 
 
343 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  42.12 
 
 
340 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  41.67 
 
 
344 aa  278  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  43.11 
 
 
342 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  42.81 
 
 
376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  42.17 
 
 
341 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40.98 
 
 
357 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  38.51 
 
 
367 aa  259  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  39.76 
 
 
343 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  39.76 
 
 
343 aa  255  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  39.34 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  37.58 
 
 
363 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  41.82 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  41.82 
 
 
345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  37.27 
 
 
363 aa  242  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  38.07 
 
 
345 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  37.74 
 
 
328 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  38.23 
 
 
341 aa  236  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  39.21 
 
 
349 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  36.69 
 
 
365 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  37.76 
 
 
348 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  36.64 
 
 
348 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  37.93 
 
 
354 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  35.63 
 
 
348 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  35.14 
 
 
347 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  37.76 
 
 
347 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  36.23 
 
 
350 aa  222  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  36.59 
 
 
339 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.72 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  34.74 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.13 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  37.85 
 
 
334 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  37.54 
 
 
346 aa  208  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  33.33 
 
 
350 aa  208  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  35.74 
 
 
640 aa  208  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  34.53 
 
 
349 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  36.28 
 
 
346 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.11 
 
 
351 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  34.64 
 
 
334 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  32.53 
 
 
342 aa  203  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  36.26 
 
 
346 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  35.93 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  31.86 
 
 
349 aa  199  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.85 
 
 
349 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  33.83 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  33.23 
 
 
624 aa  192  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  34.23 
 
 
639 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.43 
 
 
343 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.61 
 
 
365 aa  188  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  34.86 
 
 
340 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  32.02 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  33.02 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.02 
 
 
631 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  32.27 
 
 
364 aa  181  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.26 
 
 
369 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  30.2 
 
 
368 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  30.37 
 
 
368 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  31.91 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32 
 
 
366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  30.4 
 
 
371 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  31.31 
 
 
347 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  30.35 
 
 
375 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  29.51 
 
 
368 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  30.66 
 
 
369 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  28.94 
 
 
368 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  29.68 
 
 
370 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  29.68 
 
 
370 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  28.21 
 
 
368 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  30.35 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  29.39 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  28.12 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  29.11 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  29.63 
 
 
368 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  29.39 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  29.11 
 
 
370 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  29.11 
 
 
370 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  29.64 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  29.89 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  29.51 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  28.82 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  29.31 
 
 
368 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  30.06 
 
 
330 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  29.11 
 
 
367 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>