More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0645 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0078  mate efflux family protein  78.82 
 
 
439 aa  694    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.129262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0645  DcuC protein  100 
 
 
439 aa  869    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  60.05 
 
 
440 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0648  mate efflux family protein  53.88 
 
 
440 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.849411  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0795  conserved hypothetical integral membrane protein, MATE family efflux protein  51.83 
 
 
438 aa  436  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.472325  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0722  MATE efflux family protein  50.23 
 
 
438 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0500546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1050  MATE efflux family protein  50.68 
 
 
438 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0807602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0648  MATE efflux family protein  50.46 
 
 
438 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  43.25 
 
 
446 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  38.74 
 
 
450 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  35.78 
 
 
450 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  33.79 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  35.39 
 
 
464 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
464 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  34.7 
 
 
464 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  34.7 
 
 
464 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
464 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  33.96 
 
 
464 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  34.47 
 
 
464 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
464 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  34.7 
 
 
464 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  33.79 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  34.03 
 
 
463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  34.02 
 
 
464 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  34.01 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0649  MATE efflux family protein  31.8 
 
 
453 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3656  MATE efflux family protein  31.57 
 
 
453 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3589  MATE efflux family protein  31.57 
 
 
476 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3779  MATE efflux family protein  31.8 
 
 
453 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3187  MATE efflux family protein  32.11 
 
 
486 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3315  MATE efflux family protein  30.59 
 
 
456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0638  MATE efflux family protein  30.59 
 
 
456 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3485  MATE efflux family protein  30.82 
 
 
453 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000940  Na+ driven multidrug efflux pump  29.98 
 
 
446 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000926882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0802  MATE efflux family protein  30.12 
 
 
453 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06935  Na+-driven multidrug efflux pump  29.75 
 
 
446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0009  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.17 
 
 
555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0446  multi anti extrusion protein MatE  29.84 
 
 
455 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.81 
 
 
469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  24.56 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  24.56 
 
 
495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  24.56 
 
 
547 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  24.56 
 
 
546 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  24.56 
 
 
495 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  24.56 
 
 
547 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  24.56 
 
 
546 aa  140  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2829  hypothetical protein  24.34 
 
 
484 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000399298  normal  0.437543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  24.55 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.44 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7312  hypothetical protein  23.29 
 
 
458 aa  131  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0875  mate efflux family protein  24.67 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  23.56 
 
 
453 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0347  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
454 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  24.77 
 
 
458 aa  124  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
445 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2574  hypothetical protein  25.67 
 
 
480 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  22.59 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0441  MATE efflux family protein  24.89 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000223642  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1132  mate efflux family protein  25.61 
 
 
446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0193769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1694  hypothetical protein  24.23 
 
 
474 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.832751  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2504  hypothetical protein  24.23 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2407  hypothetical protein  24.23 
 
 
476 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1504  hypothetical protein  24.78 
 
 
502 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.969676  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  23.72 
 
 
445 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3106  hypothetical protein  24.55 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  24.28 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  22.77 
 
 
461 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1590  hypothetical protein  24.62 
 
 
476 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00267858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.46 
 
 
470 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1724  multi anti extrusion protein MatE  26.19 
 
 
471 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  24.25 
 
 
455 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1531  hypothetical protein  24.01 
 
 
478 aa  103  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  23.9 
 
 
445 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  22.25 
 
 
462 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  23.68 
 
 
460 aa  99.8  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  23.41 
 
 
450 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
464 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.28 
 
 
464 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  21.58 
 
 
475 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0056  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  22.63 
 
 
491 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  21.08 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  21.72 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  23.84 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  21.49 
 
 
463 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  23.64 
 
 
483 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  23.19 
 
 
450 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  22.12 
 
 
469 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.13 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  24.32 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  22.12 
 
 
469 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  23.77 
 
 
468 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  23.3 
 
 
468 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  22.82 
 
 
452 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.39 
 
 
469 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  22.39 
 
 
469 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  21.9 
 
 
461 aa  89.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.49 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  23.41 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>