283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0547 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
253 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  81.42 
 
 
253 aa  417  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  54.47 
 
 
257 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  53.33 
 
 
255 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  52.76 
 
 
255 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  57.48 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  52.36 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  50.2 
 
 
257 aa  236  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  44.98 
 
 
254 aa  196  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  34.13 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.33 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  30.04 
 
 
257 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  31.13 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.93 
 
 
255 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  32.58 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  28.76 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.97 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  35.62 
 
 
253 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  29.83 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  28.93 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  27.2 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  30.25 
 
 
260 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  27.78 
 
 
265 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  28.1 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  27.4 
 
 
266 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
259 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  32.86 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  29.22 
 
 
264 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 
260 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  34.84 
 
 
257 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  29.69 
 
 
261 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  30.09 
 
 
255 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
257 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  26.47 
 
 
256 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  27.73 
 
 
256 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.67 
 
 
264 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  30.45 
 
 
260 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  28.89 
 
 
263 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 
264 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.63 
 
 
255 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  30 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.82 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  27.35 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  28.76 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  25.52 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  32.06 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  26.22 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  29.69 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 
261 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  26.96 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  27.7 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.64 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  31.9 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 
260 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  32.3 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  28.3 
 
 
260 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  27.83 
 
 
260 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  26.97 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.7 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  32.86 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.94 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.94 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  25.21 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  23.89 
 
 
258 aa  87  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  29.75 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  27.93 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 
259 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  26.32 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  27.51 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  25.97 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  25.35 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  32.21 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0243  lateral flagellar export/assembly protein LfiR  28.85 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  26.14 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  27.19 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  28.85 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  32.21 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  27 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  27.07 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  27.16 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  27.16 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>