More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0509 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0509  P-protein  100 
 
 		 323 aa  659    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  75.23 
 
 		 323 aa  508  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  60.19 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1289  RluA family pseudouridine synthase  55.15 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0438774  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1296  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  55.73 
 
 		 322 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0445  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  55.73 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1416  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  54.8 
 
 		 322 aa  324  2e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0639  pseudouridine synthase, RluA family  50.94 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0609  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  53.29 
 
 		 320 aa  315  7e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0783  pseudouridine synthase, RluD  50.68 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  44.21 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  38.6 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  39.72 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  39.93 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  44.96 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  44.24 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.97 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.92 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  40.65 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  40.29 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  39.74 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  40.7 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2574  pseudouridine synthase, RluA family  39.07 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0131416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.66 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  39.73 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  39.5 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.61 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  41.49 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.76 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.15 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  38.06 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  39.24 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  40.21 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  37.76 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.01 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  38.54 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  41.14 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  41.14 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.25 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  38.6 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.02 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  39.79 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  38.41 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.15 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.68 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  40.55 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  39.07 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  40.91 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.62 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  37.84 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  40.58 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  40.22 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  40.58 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.58 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  40.58 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  40.58 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  40.58 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  40.93 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  39.51 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.22 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.99 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  37.95 
 
 		 329 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  40.68 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.54 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0087  RluA family pseudouridine synthase  36.05 
 
 		 344 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  39.26 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  37.85 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  37.1 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  34.8 
 
 		 541 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7584  pseudouridine synthase, RluA family  36.74 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0816319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.09 
 
 		 319 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.87 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  37.92 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  34.93 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.62 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2003  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.3 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.704766  normal  0.26865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  38.54 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0359  pseudouridine synthase RluD  37.1 
 
 		 426 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000104546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.26 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  38.14 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  39.64 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  36.03 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2431  pseudouridine synthase, RluD  36.16 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0293774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.75 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  40.07 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.76 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  35.29 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  35.45 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.99 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2822  RluA family pseudouridine synthase  34.43 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000591979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0454  pseudouridine synthase RluD  36.91 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  35.67 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.99 
 
 		 347 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  35.71 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  34.7 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15960  predicted protein  35.85 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  36.84 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  35.97 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>