284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0476 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  100 
 
 
256 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  56.64 
 
 
256 aa  315  5e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 
276 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  37.88 
 
 
273 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  37.12 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  37.12 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  36.74 
 
 
273 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  35.88 
 
 
273 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  35.5 
 
 
273 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  34.09 
 
 
273 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 
284 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  35.11 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  31.37 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 
270 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  35 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 
276 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  29.59 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  31.58 
 
 
276 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 
401 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.08 
 
 
409 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  29.27 
 
 
409 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  29.27 
 
 
409 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.05 
 
 
409 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  29.51 
 
 
409 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
409 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  29.51 
 
 
409 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 
409 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  30.13 
 
 
373 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 
319 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  28.36 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  28.29 
 
 
407 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  30.4 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.29 
 
 
409 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 
426 aa  95.1  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  26.4 
 
 
415 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  45.26 
 
 
383 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  27.89 
 
 
409 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  27.89 
 
 
409 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  27.94 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.89 
 
 
407 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
278 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  29.79 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 
297 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  44.21 
 
 
366 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.27 
 
 
306 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.5 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  23.69 
 
 
659 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  30.09 
 
 
488 aa  85.9  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  28.94 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 
417 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  27.89 
 
 
417 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  27.89 
 
 
437 aa  85.5  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 
373 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  30.34 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  23.83 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  23.83 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  30.21 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 
283 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
659 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
660 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  23.4 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  23.4 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.87 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  25.56 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2127  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  27.44 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  38.89 
 
 
348 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  38.89 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  44.32 
 
 
349 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 
371 aa  75.5  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  25.73 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  23.74 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.82 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  23.08 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  23.08 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  21.62 
 
 
640 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  25.4 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.41 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  21.55 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>