24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0460 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0460  hydroxylamine reductase (hybrid-cluster protein; HCP)  100 
 
 
709 aa  1420    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00649347  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1220  acetyltransferase  46.71 
 
 
713 aa  651    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.60212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1213  general glycosylation pathway protein  38.23 
 
 
708 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0452  iron chelatin ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
699 aa  481  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.210774  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1383  general glycosylation pathway protein  33.86 
 
 
758 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0954  general glycosylation pathway protein  34.4 
 
 
729 aa  426  1e-118  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.16886  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1767  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  34.51 
 
 
715 aa  411  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1474  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  32.91 
 
 
699 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1143  general glycosylation pathway protein  34.23 
 
 
713 aa  398  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1253  oligosaccharide transferase to N-glycosylate proteins  35.21 
 
 
712 aa  399  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1268  general glycosylation pathway protein  34.13 
 
 
713 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0595  general glycosylation pathway protein  34.23 
 
 
713 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3265  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.72 
 
 
704 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0285  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  21.79 
 
 
736 aa  89.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.272509  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0846  hypothetical protein  30.69 
 
 
782 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0746  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  30.56 
 
 
816 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1810  hypothetical protein  31.25 
 
 
758 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601276  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3699  hypothetical protein  21.77 
 
 
722 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0735  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.08 
 
 
853 aa  55.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  22.01 
 
 
840 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0075  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  24.08 
 
 
712 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.70229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1249  oligosaccharyl transferase STT3 subunit  18.63 
 
 
851 aa  48.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.209771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  22.01 
 
 
837 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49512  predicted protein  27.85 
 
 
743 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>