More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0347 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
301 aa  613  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  67.33 
 
 
301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  53.82 
 
 
303 aa  334  9e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  50.66 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  50.66 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  50.33 
 
 
305 aa  312  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1534  methionyl-tRNA formyltransferase  52.16 
 
 
304 aa  309  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  50.5 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  51.64 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  50.49 
 
 
319 aa  281  8.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  41.29 
 
 
311 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 
312 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  41.31 
 
 
318 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 
318 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.58 
 
 
311 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.13 
 
 
315 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.41 
 
 
312 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 
318 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  40.82 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  42.72 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 
318 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
318 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 
310 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
318 aa  218  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 
318 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 
310 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 
318 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 
320 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.31 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 
359 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 
321 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.69 
 
 
308 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
314 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 
305 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
315 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
315 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 
314 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 
318 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
369 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  37.3 
 
 
314 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 
311 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
314 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 
307 aa  205  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  37.83 
 
 
318 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  37.99 
 
 
306 aa  205  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
314 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
314 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  37.1 
 
 
311 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
314 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
314 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 
315 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  40.71 
 
 
309 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 
319 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 
314 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 
319 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 
309 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 
313 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  37.17 
 
 
319 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 
315 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 
315 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 
315 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  37.91 
 
 
315 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  37.91 
 
 
315 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 
314 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  38.89 
 
 
319 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2841  methionyl-tRNA formyltransferase  38.85 
 
 
334 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 
307 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 
314 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 
314 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  38.64 
 
 
320 aa  202  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  40.26 
 
 
310 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 
314 aa  201  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.94 
 
 
315 aa  201  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  36.96 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  38.59 
 
 
308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  36.75 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3015  methionyl-tRNA formyltransferase  37.46 
 
 
323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  37.18 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  37.25 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  37.58 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 
307 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>