More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0336 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  100 
 
 
214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  89.1 
 
 
213 aa  395  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  66.83 
 
 
222 aa  292  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  59.62 
 
 
211 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  59.62 
 
 
211 aa  290  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  59.13 
 
 
211 aa  289  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  60.68 
 
 
210 aa  284  7e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  54.41 
 
 
210 aa  244  8e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  51.44 
 
 
207 aa  238  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  47.62 
 
 
213 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  49.49 
 
 
200 aa  218  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.91 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  41.67 
 
 
242 aa  165  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  40.1 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  42.23 
 
 
219 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  41.58 
 
 
242 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  41.58 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  43.14 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  41.09 
 
 
242 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  39.71 
 
 
248 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  41.75 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  42.29 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  41.84 
 
 
246 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  42.71 
 
 
225 aa  160  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  40.59 
 
 
230 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  41.03 
 
 
267 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  41.03 
 
 
267 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 
210 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  37.25 
 
 
225 aa  157  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  40.38 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  39.34 
 
 
220 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  40.38 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  41.26 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  40.19 
 
 
219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  40.78 
 
 
239 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  40.19 
 
 
219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  40.19 
 
 
219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  40.78 
 
 
239 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  40.19 
 
 
219 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  37.86 
 
 
216 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  37.25 
 
 
225 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  40.78 
 
 
239 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  41.75 
 
 
219 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  39.41 
 
 
230 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  40.78 
 
 
219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  36.54 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  39.22 
 
 
219 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  39.22 
 
 
219 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  39.22 
 
 
219 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  39.22 
 
 
219 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  39.22 
 
 
219 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  39.22 
 
 
219 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  38.68 
 
 
234 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  38.92 
 
 
225 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  38.92 
 
 
225 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  38.35 
 
 
237 aa  153  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  40.72 
 
 
278 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  42.13 
 
 
231 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  42.58 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  38.21 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  37.07 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  38.21 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  38.21 
 
 
219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  38.24 
 
 
211 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  38.02 
 
 
207 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  38.24 
 
 
219 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  40.72 
 
 
284 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  39.02 
 
 
217 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  35.71 
 
 
221 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  38.24 
 
 
219 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40.3 
 
 
356 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  39.7 
 
 
211 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  38.24 
 
 
211 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  37.86 
 
 
220 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  38.54 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  35.85 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  39.22 
 
 
239 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.25 
 
 
230 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  37.75 
 
 
211 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  37.86 
 
 
225 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  36.23 
 
 
218 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  34.43 
 
 
228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  36.41 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  35.24 
 
 
255 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  33.99 
 
 
210 aa  144  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 
213 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  39.22 
 
 
211 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  39.22 
 
 
211 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  36.36 
 
 
225 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  36.22 
 
 
228 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  36.22 
 
 
228 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  36.54 
 
 
234 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  32.39 
 
 
217 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  33.99 
 
 
213 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  37.8 
 
 
219 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  37.8 
 
 
223 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  35.96 
 
 
215 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  35.92 
 
 
214 aa  141  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>