More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0315 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0315  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 406 aa  838    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  34.96 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  33.91 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  31.03 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  33.62 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  32.8 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  33.52 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  31.87 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  32.58 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  32.39 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  30.73 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  33.69 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  31.78 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  33.16 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  31.78 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  30.64 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  30.73 
 
 		 422 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  30.71 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  31.89 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  30.41 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  30.19 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  32.4 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  32.13 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  30.27 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  32.89 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  33.7 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  32.75 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  31.2 
 
 		 402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  30.47 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  30.46 
 
 		 413 aa  172  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  31.35 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  30.51 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  32.82 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.03 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  30.69 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  30.27 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  29.02 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  30.27 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  28.81 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  31.42 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  30.43 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  31.94 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  31.6 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  33.59 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.32 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.32 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.32 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  31.28 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  31.28 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  28.12 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  31.28 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  32.49 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  29.97 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  30.47 
 
 		 419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  30.03 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  28.72 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  30.08 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  29.06 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  30.21 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.87 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29.93 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  30.08 
 
 		 419 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  31.13 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  28.72 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  30.21 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  29.35 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  31.18 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  30.05 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  29.2 
 
 		 428 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  32.24 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  31.72 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  28.28 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.39 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  29.77 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  34.06 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  29.19 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  31.14 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.28 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.53 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  29.84 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  28.64 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  30.19 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  27.41 
 
 		 404 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  28.93 
 
 		 419 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  31.81 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  29.08 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.57 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  28.97 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  28.3 
 
 		 404 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>