154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0161 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0788  copper/zinc superoxide dismutase  86.52 
 
 		 178 aa  314  3e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1330  copper/zinc superoxide dismutase  67.2 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.236149  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  67.04 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  55.19 
 
 		 170 aa  167  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  53.64 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  60.43 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2101  superoxide dismutase copper/zinc binding  57.55 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.651227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1154  copper/Zinc superoxide dismutase  51.41 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1338  superoxide dismutase, Cu-Zn  55.26 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  50.3 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  48.73 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  56.12 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  52.45 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  54.68 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  46.41 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  54.68 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  46.41 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  46.41 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  47.54 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.32 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  52.32 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3315  copper/zinc superoxide dismutase  48.37 
 
 		 195 aa  150  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0978  copper/zinc superoxide dismutase  48.37 
 
 		 189 aa  150  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3445  superoxide dismutase  48.37 
 
 		 201 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  49.01 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  55.47 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  52.11 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  45.56 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  51.72 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  52.11 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  52.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  52.52 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  51.8 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1734  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0827551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  52.52 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  51.8 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  52.94 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  50 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  43.48 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  42.01 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0703  superoxide dismutase, Cu-Zn  48.2 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0659  superoxide dismutase, Cu-Zn  48.2 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  46.1 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  41.71 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0982  putative superoxide dismutase  43.04 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000174344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.04 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.98 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.26 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.67 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.73 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.72 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  32.39 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  32.22 
 
 		 171 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.25 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.04 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.79 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.04 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  34.53 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.18 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.25 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.37 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.58 
 
 		 185 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  31.94 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.88 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  37.01 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.97 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  32.62 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.65 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.51 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.45 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  31.03 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  30.05 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.61 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.61 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  31.08 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.07 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.04 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.06 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.68 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  30.94 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.62 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  27.1 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  29.67 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  34.17 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.9 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.13 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.92 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  33.79 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.66 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.91 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>