More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0092 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  100 
 
 
368 aa  737  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  79.35 
 
 
368 aa  602  1e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  53.53 
 
 
367 aa  381  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  40.96 
 
 
376 aa  298  8e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  44.26 
 
 
370 aa  287  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  46.6 
 
 
369 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  45.99 
 
 
369 aa  272  5e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  46.6 
 
 
369 aa  272  6e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  39.56 
 
 
383 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  40.22 
 
 
373 aa  253  5e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  36.39 
 
 
406 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  38.12 
 
 
370 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  35.13 
 
 
379 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  36.67 
 
 
382 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.23 
 
 
377 aa  226  5e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.42 
 
 
413 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  36.81 
 
 
387 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.86 
 
 
366 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
377 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  37.58 
 
 
377 aa  223  5e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  35.22 
 
 
381 aa  223  5e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  34.95 
 
 
381 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  38.99 
 
 
396 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  36.61 
 
 
373 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  36.84 
 
 
372 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  2.96062e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  36.15 
 
 
366 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  35.36 
 
 
366 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  36.01 
 
 
382 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  35.57 
 
 
372 aa  216  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  46.28 
 
 
430 aa  216  6e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  34.53 
 
 
385 aa  215  1e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  36.8 
 
 
377 aa  215  1e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  36.52 
 
 
377 aa  214  2e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  35.82 
 
 
365 aa  213  5e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  36.16 
 
 
377 aa  213  6e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  46.22 
 
 
384 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  35.88 
 
 
377 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  36.53 
 
 
384 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.05 
 
 
384 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  34.57 
 
 
371 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  48.11 
 
 
374 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  48.11 
 
 
374 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.09 
 
 
377 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.47 
 
 
364 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  34.09 
 
 
383 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  32.6 
 
 
368 aa  201  1e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  35.65 
 
 
377 aa  201  2e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  34.53 
 
 
383 aa  200  4e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  37.88 
 
 
376 aa  198  1e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  33.81 
 
 
383 aa  198  1e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  33.79 
 
 
377 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  41.98 
 
 
382 aa  195  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  37.42 
 
 
375 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  32.32 
 
 
382 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  33.8 
 
 
377 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  37.79 
 
 
382 aa  190  3e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  34.69 
 
 
388 aa  190  3e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  33.24 
 
 
378 aa  190  3e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  33.43 
 
 
376 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  38.22 
 
 
381 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  35.79 
 
 
364 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  35.25 
 
 
344 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  31.2 
 
 
376 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  32.89 
 
 
474 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  31.16 
 
 
380 aa  184  1e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  41.29 
 
 
379 aa  185  1e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1554  hypothetical protein  33.24 
 
 
379 aa  185  1e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  37.32 
 
 
378 aa  185  1e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
394 aa  184  2e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  34.95 
 
 
378 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 
374 aa  183  5e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  33.15 
 
 
382 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  31.56 
 
 
371 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  32.22 
 
 
374 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  34.13 
 
 
376 aa  182  9e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  32.51 
 
 
378 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  32.22 
 
 
447 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  32.41 
 
 
378 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  41.91 
 
 
394 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  31.67 
 
 
374 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  32.46 
 
 
388 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  31.67 
 
 
374 aa  180  3e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  34.29 
 
 
384 aa  180  3e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.39 
 
 
376 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  32.01 
 
 
375 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  34.52 
 
 
376 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  33.24 
 
 
374 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  33.54 
 
 
368 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  35.31 
 
 
382 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33.13 
 
 
383 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  33.84 
 
 
386 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  30.53 
 
 
373 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  39.38 
 
 
374 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  35.49 
 
 
376 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  39.38 
 
 
374 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  34.73 
 
 
370 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  31.79 
 
 
378 aa  174  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  31.79 
 
 
378 aa  174  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  39.92 
 
 
406 aa  172  6e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  32.64 
 
 
357 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>