132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0090 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  67.83 
 
 
313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  40.13 
 
 
288 aa  218  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  39.94 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  25.24 
 
 
312 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.51 
 
 
296 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.27 
 
 
296 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.27 
 
 
296 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  25.91 
 
 
433 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  24.92 
 
 
312 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  25.24 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.39 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.28 
 
 
312 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  23.86 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  26.71 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  24 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.46 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  23.53 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  24.92 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  24.85 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  23.03 
 
 
334 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  25.8 
 
 
579 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  25.35 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  24.52 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  27.66 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  26.05 
 
 
455 aa  87  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  25.51 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  23.78 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  30.66 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.66 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  22.81 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  23.15 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  23.81 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  24.37 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  22.73 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  25.79 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  21.98 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  21.98 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.89 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  24.57 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  26.41 
 
 
300 aa  79  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  23.34 
 
 
456 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  22.8 
 
 
313 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  22.97 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  21.75 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  25.85 
 
 
367 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  25.82 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  23 
 
 
456 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.34 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  24.41 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  24.04 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.45 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  20.73 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  24.55 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  21.67 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  24.62 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  24.27 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  25.89 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  25.54 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  25.37 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  24.15 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  22.79 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  22.79 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  22.79 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.11 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  25.41 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  19.93 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  23.05 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  23.94 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  23.81 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  19.75 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.82 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  24.55 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  24.15 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  20.56 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  22.48 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  22.66 
 
 
369 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  28.77 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  25.46 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  20.58 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  23.62 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  25.41 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  21.3 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.21 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  23.08 
 
 
398 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  20.46 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  23.9 
 
 
310 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  20.46 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  21.73 
 
 
313 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  26.77 
 
 
378 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  19.93 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  21.84 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>