139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0084 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  100 
 
 
100 aa  197  4e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  2.95238e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  77 
 
 
100 aa  162  1e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  54.46 
 
 
101 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  52.38 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  51.49 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  51.49 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  51.49 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  50.48 
 
 
104 aa  94.4  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  48.57 
 
 
105 aa  79.7  1e-14  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  39.81 
 
 
155 aa  70.5  7e-12  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  45.54 
 
 
98 aa  69.3  2e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  38.27 
 
 
102 aa  57.8  6e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  38.61 
 
 
103 aa  56.6  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
102 aa  55.8  2e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.35471e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  38.61 
 
 
104 aa  56.2  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  38.61 
 
 
104 aa  56.2  2e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  35.48 
 
 
237 aa  55.1  3e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  37.61 
 
 
112 aa  54.3  5e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  6.17346e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  34.88 
 
 
103 aa  53.5  1e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  34.29 
 
 
107 aa  52.8  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  35.21 
 
 
209 aa  52.4  2e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  28.3 
 
 
216 aa  52.8  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  35.58 
 
 
103 aa  52.4  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  40.26 
 
 
102 aa  52.4  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  2.91429e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
205 aa  51.2  4e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  31.48 
 
 
108 aa  51.2  5e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  27.36 
 
 
217 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  36.62 
 
 
202 aa  50.8  6e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
192 aa  49.7  1e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.98815e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.56 
 
 
205 aa  49.7  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
104 aa  50.1  1e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.03 
 
 
205 aa  49.7  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  39.44 
 
 
104 aa  49.3  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.31636e-05  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  38.57 
 
 
200 aa  48.9  2e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  38.57 
 
 
200 aa  48.9  2e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  39.22 
 
 
102 aa  48.9  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  37 
 
 
101 aa  48.5  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  38.61 
 
 
99 aa  48.5  3e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  26.92 
 
 
216 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  31.71 
 
 
179 aa  48.1  4e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  34.95 
 
 
98 aa  47.8  5e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  32.35 
 
 
105 aa  47.4  6e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  32.35 
 
 
105 aa  47.4  6e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  32.35 
 
 
105 aa  47.4  6e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  42.05 
 
 
418 aa  47.4  7e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  32.18 
 
 
207 aa  47  8e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.18 
 
 
207 aa  47  8e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  32.18 
 
 
207 aa  47  8e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  35.21 
 
 
224 aa  47  9e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.76036e-06  hitchhiker  2.15746e-05 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  28.57 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  36.36 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  29.27 
 
 
318 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  30 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  32.94 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  35.21 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  36.19 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  31.73 
 
 
266 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  26.6 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  28.24 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  30.86 
 
 
207 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  36.47 
 
 
292 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  35.06 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  33.8 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  35.06 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  35.06 
 
 
262 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1821  cytochrome c-553  31 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  4.01467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  27.59 
 
 
223 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  34.67 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  34.67 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  33.33 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  33.33 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  28.74 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  39.62 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  36.28 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  36.14 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  28.04 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  29.47 
 
 
243 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  37.38 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  33.33 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  33.64 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  29.58 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.45105e-09  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  38.83 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.4603e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  37.93 
 
 
102 aa  42  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  38.03 
 
 
98 aa  42  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  28.74 
 
 
207 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  38.83 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  2.37935e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  38.83 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.37114e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  25.71 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  26.32 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  29.58 
 
 
206 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  28.74 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  27.47 
 
 
110 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  28.72 
 
 
206 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  37.89 
 
 
270 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  28.74 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.36847e-08  unclonable  5.12206e-12 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>