More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0081 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  100 
 
 
301 aa  607  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  82.72 
 
 
321 aa  517  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.61 
 
 
312 aa  345  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.62 
 
 
312 aa  340  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  56 
 
 
310 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.33 
 
 
310 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.33 
 
 
310 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  56.77 
 
 
307 aa  325  7e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  59.14 
 
 
306 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  55.33 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  57.14 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  55.48 
 
 
306 aa  305  9.000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  53.97 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  58.75 
 
 
306 aa  298  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  58.19 
 
 
307 aa  297  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  50.83 
 
 
304 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  55.3 
 
 
305 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  51.8 
 
 
311 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  58.19 
 
 
307 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  50.5 
 
 
304 aa  296  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  57.86 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  57.86 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  57.86 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  57.86 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  57.48 
 
 
307 aa  295  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  57.86 
 
 
307 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  57.14 
 
 
307 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  58.19 
 
 
307 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  54.3 
 
 
302 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  54.3 
 
 
308 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0537  cysteine synthase  58.47 
 
 
321 aa  293  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00106309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  52.67 
 
 
305 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  52.33 
 
 
302 aa  293  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  58.53 
 
 
308 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  52.49 
 
 
305 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  52.81 
 
 
318 aa  291  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0334  cysteine synthase A  56.29 
 
 
308 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  57.53 
 
 
308 aa  289  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  51.33 
 
 
305 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  51.67 
 
 
299 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  54.46 
 
 
309 aa  286  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  53.45 
 
 
291 aa  287  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  55.23 
 
 
329 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  51.69 
 
 
307 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  51.5 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  53.49 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  53.49 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  54.43 
 
 
327 aa  285  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  50.83 
 
 
306 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  52.41 
 
 
290 aa  285  9e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  50.83 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  51.32 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  51 
 
 
299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  51.33 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  52.98 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  49.67 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  51.5 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  53.11 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  53.47 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  51.01 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  55.41 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  49.33 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  49.83 
 
 
306 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  53.11 
 
 
339 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  52.84 
 
 
305 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  50.66 
 
 
311 aa  281  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  55.08 
 
 
309 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  51.99 
 
 
305 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  51.99 
 
 
305 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  51.16 
 
 
308 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  52.17 
 
 
300 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  52.51 
 
 
300 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  53.29 
 
 
311 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  51.66 
 
 
305 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  51.01 
 
 
302 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  51.01 
 
 
305 aa  280  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  51.99 
 
 
305 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  51.99 
 
 
305 aa  279  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  50.51 
 
 
301 aa  279  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  51.66 
 
 
305 aa  278  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  52.79 
 
 
327 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  52.16 
 
 
321 aa  278  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  51.97 
 
 
309 aa  278  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  51.32 
 
 
305 aa  278  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  51.32 
 
 
305 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  49.5 
 
 
306 aa  278  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  53.11 
 
 
324 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  53.29 
 
 
308 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  51.32 
 
 
307 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  51.32 
 
 
305 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  53.47 
 
 
309 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  51.32 
 
 
305 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  51.99 
 
 
309 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  51.15 
 
 
317 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  49.83 
 
 
309 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  53.59 
 
 
309 aa  275  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  52.48 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  55.08 
 
 
316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  52.96 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  50.5 
 
 
309 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>