37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0059 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0059  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.457756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0694  hypothetical protein  78.06 
 
 
199 aa  321  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1628  thioredoxin domain-containing protein  44.56 
 
 
201 aa  167  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.325697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0711  thioredoxin domain-containing protein  43.89 
 
 
198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1249  thioredoxin domain-containing protein  43.56 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1124  thioredoxin domain-containing protein  43.56 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1061  possible periplasmic thioredoxin  47.95 
 
 
205 aa  159  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0616  thioredoxin domain-containing protein  42.08 
 
 
200 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.28635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1112  thioredoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
197 aa  150  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  34.16 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  28.36 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  28.42 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  24.38 
 
 
211 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.19 
 
 
437 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000020628  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.06 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  30.6 
 
 
184 aa  48.9  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.48 
 
 
175 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  32.58 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.08 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
195 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  23.7 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 
166 aa  45.1  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  25.26 
 
 
188 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.93 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.6 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  24.26 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  26.77 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  24.26 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  27.59 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  29.7 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.79 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6263  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.61 
 
 
195 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  36.73 
 
 
279 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.88 
 
 
200 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 
203 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>