More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0051 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2001  alanyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
875 aa  694  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79189e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
874 aa  721  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
874 aa  749  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
874 aa  748  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1642  alanyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
887 aa  712  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.338529  hitchhiker  2.32232e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
875 aa  721  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
892 aa  746  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
874 aa  748  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0051  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
852 aa  1748  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
876 aa  758  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
876 aa  758  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
865 aa  749  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
865 aa  719  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4081  alanyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
884 aa  685  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
865 aa  721  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  8.18492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
875 aa  716  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.0723e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0101  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
884 aa  659  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5834  alanyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
886 aa  676  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
874 aa  723  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
874 aa  749  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  6.88194e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5607  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
892 aa  681  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346592  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3763  alanyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
897 aa  686  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469111  normal  0.276016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
863 aa  657  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
876 aa  756  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
875 aa  716  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
883 aa  700  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3979  alanyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
897 aa  685  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.567891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
877 aa  640  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
891 aa  693  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2579  alanyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
913 aa  733  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159446  normal  0.328441 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0686  alanyl-tRNA synthetase  80.35 
 
 
852 aa  1427  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00144447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
863 aa  659  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
896 aa  740  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1038  alanyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
878 aa  664  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
876 aa  726  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
860 aa  738  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
892 aa  696  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
892 aa  741  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
875 aa  743  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
883 aa  712  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
874 aa  675  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
878 aa  655  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
874 aa  750  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
874 aa  712  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
885 aa  699  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0508  alanyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
887 aa  671  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52047  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0986  alanyl-tRNA synthetase  71.68 
 
 
845 aa  1216  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
875 aa  716  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.22674e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1429  alanyl-tRNA synthetase  70.67 
 
 
842 aa  1220  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
904 aa  664  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3211  alanyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
875 aa  716  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1987  alanyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
885 aa  690  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
874 aa  745  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
874 aa  692  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
872 aa  701  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  4.64441e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
887 aa  679  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
859 aa  654  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 
903 aa  718  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  1.35737e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
897 aa  685  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
874 aa  712  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1614  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
869 aa  704  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34460  alanyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
874 aa  701  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1072  alanyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 
845 aa  1224  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
874 aa  738  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
887 aa  727  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
865 aa  739  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
876 aa  689  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5505  alanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
886 aa  677  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
905 aa  675  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0290  alanyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
892 aa  653  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0173266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
879 aa  697  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
877 aa  717  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2821  alanyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
891 aa  693  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29967  normal  0.126573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
895 aa  688  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3176  alanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
874 aa  720  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
884 aa  697  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1667  alanyl-tRNA synthetase  68.32 
 
 
846 aa  1193  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0503075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
860 aa  760  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
890 aa  652  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
872 aa  732  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1116  alanyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
875 aa  716  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0502279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
880 aa  719  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
879 aa  686  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
879 aa  687  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
875 aa  671  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
875 aa  731  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  49.42 
 
 
876 aa  757  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0998  alanyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
875 aa  707  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.932608  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
893 aa  691  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
874 aa  749  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  2.63081e-10 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1571  alanyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
873 aa  685  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
889 aa  683  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
886 aa  654  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
876 aa  722  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
876 aa  679  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
891 aa  692  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00147  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 
882 aa  679  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
888 aa  689  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
874 aa  716  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
876 aa  757  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>