More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0040 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0040  RNA methyltransferase  100 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  74.03 
 
 		 161 aa  246  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0913  RNA methyltransferase  70.59 
 
 		 155 aa  234  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0421038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0908  RNA methyltransferase  69.28 
 
 		 155 aa  231  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.002208  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0983  RNA methyltransferase  69.28 
 
 		 155 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  68.63 
 
 		 156 aa  230  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  62.89 
 
 		 162 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  61.44 
 
 		 155 aa  204  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60.13 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.116876  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.87 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.38 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.65 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.65 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.3 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.97 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.08 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.1 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  45.27 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.9 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  45.58 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.9 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.94 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.33 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  44.59 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.22 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  44.3 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  41.33 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.59 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  45.95 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.84 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.98 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  44.59 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  43.62 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  45.27 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.89 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  44.08 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  44.08 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.57 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.72 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  43.12 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0078  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.54 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.24 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.83 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  40.94 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  44.08 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.22 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  42 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  42 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40.67 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.33 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.16 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.33 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.78 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.49 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  42 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  40.27 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  41.33 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  41.61 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  43.84 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  39.33 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.52 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1472  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.86 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0119863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.33 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  37.58 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.93 
 
 		 188 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.48 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 179 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  38 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  38.26 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1648  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.993753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  38 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.76 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  41.06 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.76 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  39.33 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.74 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  39.6 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  38.67 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.6 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.6 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  39.6 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  39.6 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.74 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  38 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  39.6 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.61 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1037  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.84 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  41.61 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.47 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>