More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0036 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
355 aa  719  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  80.56 
 
 
356 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  78.59 
 
 
356 aa  576  1e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  77.18 
 
 
355 aa  565  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  69.01 
 
 
355 aa  512  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  68.08 
 
 
357 aa  508  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
360 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.26 
 
 
360 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.39 
 
 
358 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.8 
 
 
362 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.82 
 
 
360 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.66 
 
 
360 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.54 
 
 
360 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
360 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.54 
 
 
357 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.97 
 
 
360 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 
350 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.47801e-05  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.43 
 
 
371 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.51 
 
 
355 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.53808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.28 
 
 
358 aa  421  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.31 
 
 
357 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.01 
 
 
361 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  61.01 
 
 
361 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
360 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.97 
 
 
360 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.74 
 
 
352 aa  418  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1920  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 
353 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
360 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
360 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.24 
 
 
362 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.23 
 
 
356 aa  415  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.94 
 
 
362 aa  417  1e-115  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.1 
 
 
364 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.29 
 
 
371 aa  417  1e-115  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.19 
 
 
354 aa  415  1e-115  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.83 
 
 
351 aa  415  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.4 
 
 
357 aa  415  1e-115  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.46 
 
 
359 aa  416  1e-115  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.94 
 
 
362 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
357 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
363 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
360 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.94 
 
 
357 aa  408  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.12 
 
 
357 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  60 
 
 
360 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.83 
 
 
357 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.55 
 
 
357 aa  407  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.26941e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.47 
 
 
357 aa  407  1e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.36 
 
 
353 aa  407  1e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.36 
 
 
353 aa  407  1e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.58 
 
 
356 aa  405  1e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.42 
 
 
358 aa  406  1e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.57 
 
 
353 aa  407  1e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.06 
 
 
352 aa  407  1e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1677  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
367 aa  405  1e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
363 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 
357 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
357 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.23 
 
 
352 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
357 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.38 
 
 
358 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
359 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 
359 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.38 
 
 
358 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.23 
 
 
362 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.78 
 
 
362 aa  401  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1793  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.67 
 
 
356 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
356 aa  398  1e-110  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
360 aa  400  1e-110  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2131  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.46 
 
 
355 aa  401  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.609597  normal  0.0221523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0674  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
355 aa  399  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00238259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.21 
 
 
361 aa  400  1e-110  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  398  1e-110  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
356 aa  398  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.46 
 
 
356 aa  400  1e-110  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3952  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
355 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4627  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
355 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391224  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3343  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
357 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.06 
 
 
356 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2066  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.27 
 
 
363 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4415  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
355 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001657  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.55 
 
 
363 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
362 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.1 
 
 
373 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
357 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.66056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.64 
 
 
358 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2143  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.71 
 
 
356 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444097  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3847  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
355 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.937841 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.75 
 
 
356 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3576  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
355 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0523  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.653046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
356 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0775  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 
362 aa  391  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00816  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.99 
 
 
363 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1726  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1852  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614244  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
355 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.172832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>