More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0032 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0032  LysE family translocator protein  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.787498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1363  LysE family translocator protein  44.85 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00372502  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1022  homogentisate export protein  43.62 
 
 
199 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000262161  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1266  homogentisate export protein  39.2 
 
 
198 aa  144  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.733193  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05364  putative threonine efflux protein  34.55 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000521  putative threonine efflux protein  34.78 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1528  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2688  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.97 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
206 aa  116  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  32.58 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.358199 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4719  amino acid transporter LysE  30.16 
 
 
205 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1537  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 
207 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.798481  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2289  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
204 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1931  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0747907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
207 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 
207 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 
207 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  27.51 
 
 
207 aa  104  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1954  amino acid transporter LysE  30.57 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
229 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.979652  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2656  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
207 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0662609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2618  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
229 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  27.05 
 
 
225 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1567  amino acid transporter LysE  34.74 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1729  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.04 
 
 
207 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.339884  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1023  LysE family translocator protein  31.19 
 
 
204 aa  100  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000160759  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0883  amino acid transport protein, LysE type  32.73 
 
 
206 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.325897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1869  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.051717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2156  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 
205 aa  88.2  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.42 
 
 
211 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.59 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.22 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  29.7 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.54 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.72 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.68 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  31.29 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  31.74 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.08 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.92 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1876  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 
224 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  26.55 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  27.59 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.59 
 
 
208 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  29.34 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.84 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.06 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  27.88 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  29.89 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.59 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.29 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  23.76 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  30.94 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  31.21 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  31.07 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  30.94 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  28.83 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  28.88 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.15 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  24.37 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  27.32 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4701  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0229835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  26.29 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  30.39 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  26.55 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  24.86 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.4 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  30.25 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  27.22 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.14 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.01 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  27.69 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  27.16 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2246  amino acid efflux pump, RhtB family protein  26.8 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.747875  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>