32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0020 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0020  bacteriophage replication gene A protein  100 
 
 		 403 aa  832    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1099  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 403 aa  832    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1212  nucleoside diphosphate kinase (NDK; NDP kinase; nucleoside-2-P kinase)  39.22 
 
 		 446 aa  253  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0189  bacteriophage replication gene A protein  38.6 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2273  bacteriophage replication gene A protein  38.6 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0345  bacteriophage replication gene A protein  28.24 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00229626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2638  replication protein A  25.46 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4357  replication gene A protein  21.73 
 
 		 707 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417362  hitchhiker  0.000000000116527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2322  replication gene A  25.34 
 
 		 851 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0971146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2609  bacteriophage replication gene A  28.16 
 
 		 640 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.875079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3058  bacteriophage replication gene A protein  23.5 
 
 		 760 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00583111  decreased coverage  0.000000000126727 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05016  hypothetical protein  25.75 
 
 		 628 aa  53.5  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4315  replication gene A protein  22.84 
 
 		 761 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908807  hitchhiker  0.000153162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0892  replication gene A  25.79 
 
 		 759 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.427848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0988  replication gene A protein  23.81 
 
 		 758 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0874  replication gene A  24.68 
 
 		 687 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744565  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2663  bacteriophage replication gene A protein  24.81 
 
 		 940 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.978524  hitchhiker  0.000159961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1020  phage replication protein  24.27 
 
 		 837 aa  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3164  replication protein A  24.12 
 
 		 767 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3505  bacteriophage replication gene A  25.11 
 
 		 740 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.14007  normal  0.112396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2941  replication gene A protein  27.8 
 
 		 673 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.3159e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3496  replication gene A protein  27.8 
 
 		 673 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.35531e-26 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0975  bacteriophage replication gene A  22.22 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3057  bacteriophage replication gene A  23.11 
 
 		 798 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  normal  0.491579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0831  bacteriophage replication gene A  22.22 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2784  replication gene A  23.11 
 
 		 790 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0528107  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0918  putative replication gene A protein  23.11 
 
 		 804 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0157966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2086  replication gene A  25.49 
 
 		 730 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3837  replication gene A  24.79 
 
 		 684 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.546581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0688  bacteriophage replication gene A  24.44 
 
 		 893 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1350  bacteriophage replication gene A  23.04 
 
 		 803 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0558946  normal  0.201886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003288  putative replication protein  26.27 
 
 		 514 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.759025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>