153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0002 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0002  integrase/recombinase  100 
 
 
218 aa  433  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000442871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1147  thiol:disulfide interchange protein DsbA  82.95 
 
 
219 aa  363  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3334  DsbA family thioredoxin  64.19 
 
 
222 aa  275  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3451  disulfide isomerase  61.4 
 
 
223 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3374  disulfide isomerase  61.4 
 
 
223 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3444  disulfide isomerase  61.4 
 
 
223 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.923354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3546  disulfide isomerase  61.4 
 
 
223 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.504028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3379  disulfide isomerase  61.4 
 
 
223 aa  269  3e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1438  DSBA oxidoreductase  60.83 
 
 
220 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.44353 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1380  DSBA oxidoreductase  61.26 
 
 
221 aa  255  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172007  normal  0.0174557 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0433  disulfide isomerase  54.38 
 
 
228 aa  233  1e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.529354  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0856  disulfide isomerase  54.38 
 
 
219 aa  226  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2110  hypothetical protein  53.27 
 
 
213 aa  219  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0951  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.64 
 
 
220 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbA  40.64 
 
 
220 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.325546  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1013  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.81 
 
 
220 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000248495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0234  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  38.69 
 
 
202 aa  141  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3871  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  40 
 
 
203 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4028  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 
203 aa  128  7e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4023  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 
203 aa  127  1e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0559  thiol:disulfide interchange protein, DsbA family  33.8 
 
 
216 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1665  disulfide isomerase  29.26 
 
 
223 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3999  putative disulfide isomerase  33.16 
 
 
200 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.136528 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1021  putative thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.52 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00252175  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0954  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  29.05 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0883  thiol:disulfide interchange protein DsbA, putative  28.57 
 
 
223 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  28.34 
 
 
205 aa  77.8  1e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.72 
 
 
202 aa  76.6  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 
203 aa  75.9  4e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  29.06 
 
 
203 aa  75.9  5e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.1 
 
 
204 aa  75.5  6e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
202 aa  75.1  8e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
203 aa  74.3  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
203 aa  74.3  1e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.48 
 
 
207 aa  72.8  3e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.38937e-07  hitchhiker  6.39801e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
203 aa  72.8  3e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.20149e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  26.85 
 
 
200 aa  72.8  4e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.59 
 
 
207 aa  72  6e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.59 
 
 
207 aa  72  6e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.59 
 
 
207 aa  72  6e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
202 aa  69.7  3e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
202 aa  69.7  3e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
202 aa  69.7  3e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
202 aa  69.7  3e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0092  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 
216 aa  68.9  5e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  26.63 
 
 
203 aa  67.4  2e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.91 
 
 
207 aa  66.2  4e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.09 
 
 
207 aa  65.9  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.09 
 
 
207 aa  65.9  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.09 
 
 
207 aa  65.9  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.09 
 
 
207 aa  65.9  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.09 
 
 
207 aa  65.9  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.57644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
203 aa  65.5  6e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.32 
 
 
207 aa  65.1  7e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  3.22053e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.85 
 
 
200 aa  64.7  9e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
203 aa  64.3  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
211 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.18 
 
 
207 aa  64.7  1e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.05 
 
 
200 aa  64.3  1e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  27.45 
 
 
207 aa  63.9  2e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.11 
 
 
223 aa  63.2  3e-09  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
210 aa  62.8  4e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  1.92462e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.12 
 
 
207 aa  62.8  4e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0144  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 
210 aa  62  6e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  25.12 
 
 
200 aa  62  7e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  28.42 
 
 
213 aa  60.8  1e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 
250 aa  61.2  1e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 
217 aa  61.2  1e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64919e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 
250 aa  60.1  2e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.36 
 
 
210 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 
250 aa  60.1  3e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
221 aa  59.7  3e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.86255e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.9 
 
 
199 aa  58.9  6e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.27288e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  6.67168e-05 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  26.09 
 
 
185 aa  58.5  7e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.88 
 
 
207 aa  58.5  7e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  24.75 
 
 
208 aa  58.5  7e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 
250 aa  58.5  8e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.28483e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 
207 aa  58.2  1e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
207 aa  57.8  1e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.57 
 
 
250 aa  57.4  2e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  23.11 
 
 
210 aa  57.4  2e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0941  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
251 aa  57.4  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  28.64 
 
 
202 aa  57.4  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 
207 aa  57.4  2e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 
207 aa  57  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 
210 aa  56.2  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0964  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 
251 aa  55.8  5e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  25.47 
 
 
207 aa  55.5  6e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>