More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2145 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 356 aa  739    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 356 aa  739    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 335 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 335 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  46.86 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 346 aa  309  5e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  45.89 
 
 		 346 aa  305  8.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  45.14 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44.31 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  45.75 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 333 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  44 
 
 		 340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  44.03 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.98 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 329 aa  275  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1138  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.55 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.69 
 
 		 357 aa  272  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 384 aa  271  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.39 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1247  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 360 aa  269  5e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.258523  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  43.55 
 
 		 342 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0440  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.61 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.21 
 
 		 346 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.28 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6431  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.9 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5680  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.9 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  normal  0.353927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7076  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478137 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.32 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6416  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.32 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.15 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6975  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.03 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.35 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0485  tryptophanyl-tRNA synthetase II  38.78 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.54 
 
 		 345 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 340 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1406  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.06 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.5 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 340 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.5 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.5 
 
 		 337 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.29 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.79 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 329 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  37.5 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 404 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 327 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 330 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>