More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2133 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_2133  GGDEF family protein  100 
 
 		 332 aa  674    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.352584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.65 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.49 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  33.44 
 
 		 681 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  29.26 
 
 		 785 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.4 
 
 		 686 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.47 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2544  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.53 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.108185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  30.5 
 
 		 688 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  29.54 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2866  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.04 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.23 
 
 		 713 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.92 
 
 		 756 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0896  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.42 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.225893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.82 
 
 		 704 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1378  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.42 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  28.53 
 
 		 733 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  29.48 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.74 
 
 		 947 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1356  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.62 
 
 		 399 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.72 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  30.59 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  30.59 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  27.15 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2183  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.77 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.03 
 
 		 765 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  29.53 
 
 		 554 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4523  diguanylate cyclase  28.98 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.114375  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.33 
 
 		 781 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 1073 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.71 
 
 		 1125 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1290  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.24 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0190271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.91 
 
 		 797 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0536  diguanylate cyclase  32.3 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.190341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.42 
 
 		 841 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.68 
 
 		 792 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  26.98 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  44.88 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  32.75 
 
 		 609 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1776  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.67 
 
 		 547 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  35.22 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  31.58 
 
 		 709 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  27.97 
 
 		 836 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 1017 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3833  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.53 
 
 		 732 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  26.9 
 
 		 792 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1277  diguanylate cyclase  41.61 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  32.08 
 
 		 215 aa  96.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  33.67 
 
 		 768 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  33.67 
 
 		 768 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 1014 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0894  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  26.79 
 
 		 482 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.66 
 
 		 892 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.577778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  32.73 
 
 		 517 aa  96.3  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.43 
 
 		 557 aa  96.3  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1657  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 530 aa  95.9  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1055  sensory box protein  26.4 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3562  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.69 
 
 		 687 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.6333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1323  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.81 
 
 		 449 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1101  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1135  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3257  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.64 
 
 		 417 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  25.36 
 
 		 498 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.57 
 
 		 567 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1222  GGDEF domain-containing protein  30.7 
 
 		 410 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.55 
 
 		 619 aa  94  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1834  diguanylate cyclase  27.93 
 
 		 525 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.245567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1034  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 417 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.283599  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000161  GGDEF family protein  35.03 
 
 		 652 aa  93.2  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46573  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1665  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 530 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0098  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.29 
 
 		 642 aa  92.4  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 677 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.48 
 
 		 878 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0866778 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3033  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  24.79 
 
 		 777 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3440  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 557 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0125075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  28.79 
 
 		 758 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  29.49 
 
 		 718 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  33.49 
 
 		 880 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2200  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.86 
 
 		 637 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.95 
 
 		 739 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 960 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0963  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.18 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.8 
 
 		 724 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 611 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1354  GGDEF family protein  32.3 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3376  GGDEF domain-containing protein  27.46 
 
 		 480 aa  90.9  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.17 
 
 		 499 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 548 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.14 
 
 		 780 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3185  diguanylate cyclase  34.67 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.0939676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 371 aa  90.1  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.89 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0495  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.96 
 
 		 907 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.128556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 814 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6322  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.11 
 
 		 682 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3413  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.69 
 
 		 342 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1153  diguanylate cyclase  35.54 
 
 		 596 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.442479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.66 
 
 		 597 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>