More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2100 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  48.1 
 
 
789 aa  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  55.07 
 
 
815 aa  759    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  56.82 
 
 
757 aa  854    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  48.6 
 
 
836 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1934  DNA topoisomerase I  54.93 
 
 
815 aa  758    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  64.79 
 
 
768 aa  1062    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 
813 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  43.21 
 
 
758 aa  653    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  64.81 
 
 
759 aa  1006    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  64.95 
 
 
759 aa  1008    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  60.28 
 
 
799 aa  774    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0010  DNA topoisomerase I  52.55 
 
 
857 aa  696    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1645  DNA topoisomerase I  48.81 
 
 
924 aa  651    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  61.51 
 
 
783 aa  793    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  52.98 
 
 
841 aa  811    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  58.9 
 
 
824 aa  766    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  53.59 
 
 
779 aa  834    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  58.67 
 
 
854 aa  788    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  56.56 
 
 
758 aa  861    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  44.5 
 
 
747 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3202  DNA topoisomerase I  49.64 
 
 
915 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  44.52 
 
 
831 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  44.26 
 
 
831 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  58.81 
 
 
851 aa  922    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04049  DNA topoisomerase I  57.49 
 
 
830 aa  761    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  44.71 
 
 
751 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  58.92 
 
 
845 aa  794    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  45.97 
 
 
691 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  58.96 
 
 
823 aa  796    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  45.78 
 
 
853 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  43.47 
 
 
760 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  44.39 
 
 
831 aa  669    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  44.14 
 
 
748 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  49.34 
 
 
780 aa  682    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  43.79 
 
 
793 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  58.39 
 
 
797 aa  765    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  59.84 
 
 
834 aa  752    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  46.17 
 
 
696 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  47.45 
 
 
711 aa  672    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  53.59 
 
 
779 aa  835    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  46.03 
 
 
894 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  52.9 
 
 
783 aa  845    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  54.78 
 
 
756 aa  838    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  58.81 
 
 
851 aa  922    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  54.17 
 
 
776 aa  853    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  55.77 
 
 
758 aa  847    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  100 
 
 
765 aa  1600    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  99.74 
 
 
765 aa  1595    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  44.53 
 
 
710 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  44.84 
 
 
689 aa  631  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  43.04 
 
 
767 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  42.97 
 
 
758 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  48.37 
 
 
896 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  48.01 
 
 
894 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 
692 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  43.92 
 
 
692 aa  621  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 
692 aa  621  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 
692 aa  621  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  44.05 
 
 
691 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  44.13 
 
 
746 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  44.17 
 
 
697 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  43.78 
 
 
692 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  43.92 
 
 
692 aa  618  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  45.24 
 
 
691 aa  618  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  44.97 
 
 
693 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  43.65 
 
 
692 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  46.23 
 
 
697 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  42.73 
 
 
711 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  43.52 
 
 
692 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  44.69 
 
 
691 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  44.69 
 
 
691 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  43.39 
 
 
692 aa  611  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  43.12 
 
 
692 aa  612  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  47.52 
 
 
884 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  43.25 
 
 
692 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1282  DNA topoisomerase I  47.06 
 
 
867 aa  610  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390974  normal  0.233625 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  43.72 
 
 
706 aa  608  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0729  DNA topoisomerase I  48.62 
 
 
891 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.074453  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 
693 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  47.23 
 
 
884 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  46.65 
 
 
849 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3417  DNA topoisomerase I  47.08 
 
 
961 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0414891  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  45.99 
 
 
904 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 
703 aa  600  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  46.76 
 
 
820 aa  601  1e-170  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1005  DNA topoisomerase I  46.51 
 
 
894 aa  602  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.387965  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  45.86 
 
 
914 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  44.61 
 
 
703 aa  599  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  44.92 
 
 
816 aa  598  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  43.9 
 
 
693 aa  598  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3508  DNA topoisomerase I  46.51 
 
 
909 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.989959 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  48.29 
 
 
820 aa  595  1e-169  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  45.59 
 
 
696 aa  598  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0604  DNA topoisomerase I  46.92 
 
 
877 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  46.98 
 
 
911 aa  593  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3631  DNA topoisomerase I  46.37 
 
 
910 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  46.65 
 
 
936 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3671  DNA topoisomerase I  46.99 
 
 
885 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3308  DNA topoisomerase I  46.37 
 
 
910 aa  594  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.603325 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0843  DNA topoisomerase I  46.42 
 
 
869 aa  595  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.077347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>