More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2016 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  67.45 
 
 		 226 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  66.51 
 
 		 227 aa  296  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  66.19 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  67.14 
 
 		 215 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  66.2 
 
 		 215 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  65.73 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  65.73 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  65.73 
 
 		 215 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  66.2 
 
 		 215 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  65.73 
 
 		 215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  65.71 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  64.32 
 
 		 213 aa  287  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  61.14 
 
 		 217 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  63.33 
 
 		 216 aa  280  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  60.19 
 
 		 217 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  61.5 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  62.09 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  61.03 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  60 
 
 		 212 aa  268  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  58.96 
 
 		 217 aa  267  8e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  58.49 
 
 		 217 aa  265  5e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  59.52 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  64.11 
 
 		 215 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  58.29 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  57.82 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  55.71 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  55.71 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  57.14 
 
 		 227 aa  246  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  55.92 
 
 		 232 aa  246  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  62.18 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  52 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  51.11 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  50.67 
 
 		 244 aa  231  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  47.39 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  44.29 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  44.29 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  43.12 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  46.7 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  42.99 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  43.38 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  43.26 
 
 		 223 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  47.57 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  42.31 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  43.78 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  40.76 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  42.18 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  42 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.71 
 
 		 202 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  38.24 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.56 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 258 aa  96.3  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  37.82 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.83 
 
 		 280 aa  87.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 		 260 aa  85.1  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.83 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  27.31 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  26.61 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.75 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  27.78 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.19 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  25.81 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  34.25 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.19 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  27.95 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  26.42 
 
 		 251 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  27.59 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  27.15 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.42 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>