199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1827 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  99.26 
 
 
408 aa  796    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  100 
 
 
408 aa  803    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  44.55 
 
 
435 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  43.73 
 
 
410 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  44.92 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  44.7 
 
 
435 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  45.64 
 
 
421 aa  310  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  43.8 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  44.94 
 
 
415 aa  309  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  44.95 
 
 
431 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  46.67 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  44.94 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  41.97 
 
 
424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  44.9 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  45.27 
 
 
407 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  44.7 
 
 
431 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  45.32 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  43.64 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  44.99 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  43.58 
 
 
425 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  44.15 
 
 
424 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  44.5 
 
 
423 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  44.5 
 
 
423 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  44.5 
 
 
423 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  44.5 
 
 
423 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  44.5 
 
 
423 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  44.36 
 
 
428 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  44.74 
 
 
427 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  45.76 
 
 
421 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  41.09 
 
 
436 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  46.67 
 
 
423 aa  293  5e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  45.9 
 
 
423 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  40 
 
 
428 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  45.38 
 
 
423 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  42.65 
 
 
426 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  43.47 
 
 
426 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  44.92 
 
 
412 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  43.97 
 
 
413 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  40.64 
 
 
428 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  40.25 
 
 
429 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  42.17 
 
 
403 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 
440 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  40.98 
 
 
405 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  37.97 
 
 
412 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  35.9 
 
 
468 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  36.64 
 
 
471 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  34.24 
 
 
413 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  40 
 
 
431 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  36.08 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  35.29 
 
 
458 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.15 
 
 
432 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  33.33 
 
 
417 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  36.54 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.01 
 
 
417 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  33.33 
 
 
417 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  41.31 
 
 
485 aa  196  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  33.75 
 
 
431 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.93 
 
 
431 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  31.47 
 
 
411 aa  186  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  33.49 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  35.78 
 
 
426 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  30.26 
 
 
412 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  30.69 
 
 
418 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  31.51 
 
 
438 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  33.25 
 
 
429 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  31.51 
 
 
438 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  31.51 
 
 
438 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  31.51 
 
 
438 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  30.33 
 
 
420 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  31.51 
 
 
438 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  29.9 
 
 
414 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  31.09 
 
 
438 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  30.45 
 
 
418 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  31.09 
 
 
438 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  31.09 
 
 
438 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  31.09 
 
 
438 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  30.15 
 
 
488 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  32.02 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  30.85 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  30.66 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  31.09 
 
 
438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  30.6 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  31.5 
 
 
429 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  31.02 
 
 
438 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  32.52 
 
 
426 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  31.89 
 
 
406 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  29.25 
 
 
417 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  30.15 
 
 
419 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  31.4 
 
 
421 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  30.21 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  29.78 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  30.52 
 
 
444 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  29.33 
 
 
425 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  29.56 
 
 
431 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  28.54 
 
 
457 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  28.54 
 
 
457 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  28.64 
 
 
457 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  28.61 
 
 
457 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>