More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1782 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1782  ribonuclease PH  100 
 
 
239 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0405  ribonuclease PH  100 
 
 
237 aa  490  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  62.45 
 
 
237 aa  333  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  67.09 
 
 
237 aa  332  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  66.53 
 
 
239 aa  332  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  65.82 
 
 
237 aa  331  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  62.03 
 
 
237 aa  330  8e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  64.71 
 
 
239 aa  326  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  66.24 
 
 
238 aa  324  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0319  ribonuclease PH  64.56 
 
 
237 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  66.1 
 
 
239 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1994  ribonuclease PH  65.96 
 
 
235 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1989  ribonuclease PH  65.96 
 
 
235 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  66.1 
 
 
239 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4568  ribonuclease PH  66.67 
 
 
237 aa  321  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000188043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  62.45 
 
 
237 aa  320  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0378  ribonuclease PH  66.67 
 
 
237 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  64.14 
 
 
237 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2442  ribonuclease PH  62.45 
 
 
239 aa  318  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.987543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  64.14 
 
 
238 aa  317  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0456  ribonuclease PH  63.71 
 
 
237 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  63.14 
 
 
239 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4256  ribonuclease PH  63.29 
 
 
237 aa  316  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3604  ribonuclease PH  63.29 
 
 
237 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0352  ribonuclease PH  63.29 
 
 
237 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3777  ribonuclease PH  63.29 
 
 
237 aa  316  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  63.4 
 
 
239 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3836  ribonuclease PH  64.98 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  63.56 
 
 
239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  60.17 
 
 
245 aa  310  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  62.03 
 
 
238 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  62.03 
 
 
240 aa  308  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  62.03 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  62.45 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0369  ribonuclease PH  63.71 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  61.02 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0370  ribonuclease PH  63.71 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0395  ribonuclease PH  63.71 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000781282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0381  ribonuclease PH  63.71 
 
 
237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  62.71 
 
 
243 aa  305  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  62.03 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  62.03 
 
 
240 aa  304  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  62.45 
 
 
238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  62.03 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  61.02 
 
 
238 aa  302  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  60.34 
 
 
242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  301  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  62.45 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  62.45 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  62.45 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  62.29 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  62.45 
 
 
238 aa  301  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3479  ribonuclease PH  60.76 
 
 
239 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  62.03 
 
 
238 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  62.03 
 
 
238 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  62.03 
 
 
238 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  61.6 
 
 
240 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  61.6 
 
 
240 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  62.71 
 
 
238 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  60.76 
 
 
246 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0049  ribonuclease PH  63.14 
 
 
238 aa  299  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0056  ribonuclease PH  63.14 
 
 
238 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  60.76 
 
 
246 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4160  ribonuclease PH  63.14 
 
 
238 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  60.76 
 
 
238 aa  298  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  59.75 
 
 
238 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  59.92 
 
 
238 aa  298  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  60.08 
 
 
241 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  59.92 
 
 
246 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  60.08 
 
 
241 aa  297  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  59.92 
 
 
246 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  59.92 
 
 
246 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  59.32 
 
 
239 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4847  ribonuclease PH  62.03 
 
 
238 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104243  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  61.28 
 
 
246 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  62.88 
 
 
230 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  59.92 
 
 
246 aa  295  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  60.59 
 
 
241 aa  295  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  60.43 
 
 
246 aa  294  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  61.18 
 
 
238 aa  294  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  59.07 
 
 
238 aa  293  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  59.07 
 
 
243 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  57.87 
 
 
242 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  58.47 
 
 
238 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  58.58 
 
 
240 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  57.87 
 
 
242 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  58.05 
 
 
238 aa  291  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  60.43 
 
 
246 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  58.47 
 
 
238 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  57.81 
 
 
238 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  56.96 
 
 
238 aa  289  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  57.81 
 
 
246 aa  289  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  59.75 
 
 
238 aa  288  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  60.5 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  58.47 
 
 
238 aa  286  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  59.15 
 
 
243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>