21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1774 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1774  outer membrane protein  100 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000106277  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0413  outer membrane protein  99.13 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.43921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0043  outer membrane protein  37.08 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2013  hypothetical protein  37.08 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  30.92 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  32.18 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  29.45 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  30.85 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  30 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1138  OmpA-like transmembrane domain protein  26.67 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000563835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  27.43 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  26.54 
 
 		 318 aa  45.1  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1008  hypothetical protein  30.34 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000243922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  29.17 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  26.5 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  26.8 
 
 		 361 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  31.2 
 
 		 341 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  28.57 
 
 		 366 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  35.79 
 
 		 404 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01464  putative outer membrane protein A  29.22 
 
 		 198 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>