More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1590 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1750  ribonuclease  57.77 
 
 		 1158 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00127119  normal  0.447333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  60.99 
 
 		 1091 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2289  ribonuclease E  58.6 
 
 		 1004 aa  656    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  57.12 
 
 		 1128 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2785  ribonuclease E  57.71 
 
 		 1088 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3841  ribonuclease, Rne/Rng family protein  62.5 
 
 		 1128 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1638  ribonuclease E and G  62.7 
 
 		 1120 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  58.62 
 
 		 1015 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2657  ribonuclease, Rne/Rng family  57.77 
 
 		 1154 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00498519  hitchhiker  0.000418055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  57.51 
 
 		 1073 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1242  ribonuclease  55.14 
 
 		 928 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4166  RNAse E  62.06 
 
 		 1082 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000306864  normal  0.124166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1707  ribonuclease  57.77 
 
 		 1148 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000116835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1677  ribonuclease E  57.17 
 
 		 1216 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000377607  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0595  ribonuclease  99.44 
 
 		 718 aa  1332    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000095022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  56.16 
 
 		 1012 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2304  ribonuclease  51.59 
 
 		 1071 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2634  ribonuclease  56.6 
 
 		 1201 aa  650    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0740113  hitchhiker  0.00367459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  60.8 
 
 		 1090 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  62.52 
 
 		 1139 aa  646    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  53.59 
 
 		 1102 aa  674    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  57.14 
 
 		 1084 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  53.14 
 
 		 1175 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  63.8 
 
 		 1035 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  56.37 
 
 		 938 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1516  ribonuclease  55.24 
 
 		 1072 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00855049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  59.27 
 
 		 1070 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  56.92 
 
 		 1142 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02342  RNase E  57.41 
 
 		 1131 aa  653    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.596666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2405  RNAse E  57.61 
 
 		 1093 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2475  RNAse E  57.26 
 
 		 1095 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.350754  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1430  ribonuclease E  62.72 
 
 		 1073 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  58.1 
 
 		 1124 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1590  ribonuclease E  100 
 
 		 720 aa  1461    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000584784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2816  ribonuclease E  55.34 
 
 		 1121 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00267025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25560  ribonuclease E  58.63 
 
 		 1057 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0583784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  57.34 
 
 		 1048 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1569  ribonuclease E  57.17 
 
 		 1216 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000219809  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2567  RNAse E  57.95 
 
 		 1098 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  57.14 
 
 		 1216 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1481  ribonuclease  61.07 
 
 		 1086 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00984617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  59.24 
 
 		 1141 aa  669    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  56.8 
 
 		 1128 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  58.58 
 
 		 1065 aa  643    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1710  ribonuclease  57.77 
 
 		 1144 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000580294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  60.43 
 
 		 1056 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01517  ribonuclease E  50 
 
 		 1238 aa  633  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1898  ribonuclease E  60.11 
 
 		 1122 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000446531  hitchhiker  0.000483574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1615  ribonuclease, Rne/Rng family  58 
 
 		 1058 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000319313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  55.79 
 
 		 1067 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  55.79 
 
 		 1068 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2244  ribonuclease E  51.61 
 
 		 663 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  55.79 
 
 		 1067 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  55.79 
 
 		 1068 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  55.48 
 
 		 1113 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1321  ribonuclease E  60.12 
 
 		 904 aa  631  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0034947  normal  0.881501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  55.79 
 
 		 1067 aa  632  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  63.58 
 
 		 1024 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  63.95 
 
 		 1061 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  63.95 
 
 		 1061 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  63.95 
 
 		 1057 aa  628  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2216  ribonuclease E  51.06 
 
 		 663 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  63.95 
 
 		 1061 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  55.23 
 
 		 1060 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  63.95 
 
 		 1061 aa  628  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000115068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1619  RNAse E  60.73 
 
 		 968 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000868095  normal  0.696665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  63.95 
 
 		 1061 aa  628  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  63.95 
 
 		 1061 aa  628  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  63.95 
 
 		 1061 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  63.95 
 
 		 942 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  55.56 
 
 		 688 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  63.95 
 
 		 1061 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1481  ribonuclease E  56.87 
 
 		 885 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00665357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  49.04 
 
 		 1014 aa  623  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2678  ribonuclease, Rne/Rng family  55.68 
 
 		 1091 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.174133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  57.17 
 
 		 764 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0703  ribonuclease  54.35 
 
 		 752 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  54.4 
 
 		 1092 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  53.79 
 
 		 938 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1064  ribonuclease  55.12 
 
 		 977 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.973146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2088  ribonuclease  55.05 
 
 		 1132 aa  615  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2275  RNAse E  55.11 
 
 		 1042 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2176  ribonuclease E  54.86 
 
 		 1132 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2436  ribonuclease, Rne/Rng family  52.72 
 
 		 1061 aa  609  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  54.38 
 
 		 1096 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2440  RNAse E  54.93 
 
 		 1037 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  54.38 
 
 		 1088 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1069  ribonuclease  54.46 
 
 		 1056 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.17751  decreased coverage  0.00648425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  54.38 
 
 		 1097 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  52.93 
 
 		 1053 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  54.38 
 
 		 1111 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  51.42 
 
 		 879 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1756  ribonuclease, Rne/Rng family  50.9 
 
 		 1016 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000532878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0631  ribonuclease  54.46 
 
 		 1059 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0577121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  54.38 
 
 		 1088 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  54.38 
 
 		 1087 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1110  ribonuclease  54.46 
 
 		 1059 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  54.38 
 
 		 1087 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0396  ribonuclease, Rne/Rng family  48.99 
 
 		 865 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0970  ribonuclease, Rne/Rng family  55.03 
 
 		 1008 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>