More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1418 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  100 
 
 
436 aa  896    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  35.25 
 
 
479 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  33.18 
 
 
495 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  35.19 
 
 
435 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  33.41 
 
 
495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  34.57 
 
 
470 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  34.35 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  32.95 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  33.09 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  34.25 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  31.12 
 
 
445 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  30.71 
 
 
481 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  29.26 
 
 
463 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.95 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  27.45 
 
 
425 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.49 
 
 
436 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  30.21 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  29.26 
 
 
1199 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  27.8 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.96 
 
 
418 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  29.38 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  28.31 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  26.98 
 
 
628 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  28.19 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  26.52 
 
 
422 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  26.15 
 
 
422 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  25.55 
 
 
409 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  27.12 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  27.82 
 
 
415 aa  116  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  25.27 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  26.81 
 
 
458 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  25.66 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  25.67 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  31.19 
 
 
1274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 
474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  27.43 
 
 
422 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  25.85 
 
 
485 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 
470 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  25.54 
 
 
450 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  25.97 
 
 
442 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  26.64 
 
 
429 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  25 
 
 
418 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  24.57 
 
 
480 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.203976 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  24.61 
 
 
657 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  26.21 
 
 
442 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.33 
 
 
536 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  26.25 
 
 
426 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  24.88 
 
 
413 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  23.86 
 
 
456 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  24.54 
 
 
427 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  25.84 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  24.52 
 
 
577 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  24.38 
 
 
504 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  24.94 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  25.48 
 
 
424 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  24.82 
 
 
446 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  25.67 
 
 
476 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  24.59 
 
 
445 aa  93.2  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  24.81 
 
 
457 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  22.61 
 
 
454 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  24.04 
 
 
484 aa  90.5  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  21.32 
 
 
492 aa  90.5  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  23.89 
 
 
434 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  27 
 
 
478 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  25.43 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  27 
 
 
478 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  23.46 
 
 
463 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  23.85 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  25.06 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  23.92 
 
 
450 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  26.89 
 
 
478 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  26.56 
 
 
429 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  26.79 
 
 
478 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  26.74 
 
 
478 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  26.79 
 
 
478 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.47 
 
 
478 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.47 
 
 
478 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  26.32 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28515  corticosteroid- binding protein  24.68 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15534  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  25.18 
 
 
463 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.94 
 
 
592 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  23.9 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  24.32 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.56 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  25.44 
 
 
493 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  25.44 
 
 
493 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.18 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  25.66 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.78 
 
 
496 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  21.22 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.37 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  22.03 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  24.89 
 
 
625 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  21.52 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  21.52 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  24.24 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  24.28 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  26.14 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  24.56 
 
 
624 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>