More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1313 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  99.79 
 
 
478 aa  973    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  100 
 
 
478 aa  976    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  50.32 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  50.32 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  40.11 
 
 
449 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  38.67 
 
 
441 aa  242  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
438 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  40.05 
 
 
438 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
450 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
449 aa  232  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  36.44 
 
 
455 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.69 
 
 
513 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
458 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.42 
 
 
438 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  34.69 
 
 
499 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  32.64 
 
 
457 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
450 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  34.77 
 
 
526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  36.71 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  31.94 
 
 
457 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
456 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
455 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
449 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
455 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  35.7 
 
 
472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.95 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  37.89 
 
 
444 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
459 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
459 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  36.07 
 
 
452 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  35.66 
 
 
438 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  35.66 
 
 
438 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
462 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  36.68 
 
 
1093 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
524 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  35.58 
 
 
438 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
461 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  36.46 
 
 
514 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
448 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
445 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
444 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  35.19 
 
 
481 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  36.02 
 
 
519 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
454 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
445 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
445 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.39 
 
 
517 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  35.62 
 
 
463 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
487 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
466 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  36.87 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  36.59 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  36.59 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  36.59 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  36.59 
 
 
449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  36.59 
 
 
449 aa  200  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  37.95 
 
 
501 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.96 
 
 
443 aa  200  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
452 aa  199  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.03 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  36.03 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  36.31 
 
 
449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  33.84 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  36.03 
 
 
449 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
433 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  33.68 
 
 
467 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5498  two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  39.18 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
481 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
448 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
454 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  31.65 
 
 
496 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63160  PmrB: two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  34.66 
 
 
477 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
444 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
515 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
465 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  34.79 
 
 
454 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  31.72 
 
 
467 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
454 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
450 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  32.46 
 
 
505 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  35.54 
 
 
475 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.64 
 
 
515 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>