More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1205 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  100 
 
 
426 aa  880    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  43.63 
 
 
479 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  43.93 
 
 
479 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  47.87 
 
 
487 aa  319  7e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  47.85 
 
 
499 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  45.77 
 
 
442 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  45.77 
 
 
442 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 
552 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.72 
 
 
554 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 
548 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 
556 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  37.57 
 
 
580 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.07 
 
 
543 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  43.15 
 
 
474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.49 
 
 
534 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.46 
 
 
515 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
553 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  41 
 
 
519 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  46.04 
 
 
539 aa  256  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  41.16 
 
 
517 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  40.75 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 
498 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  36.5 
 
 
524 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  35.36 
 
 
518 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  39.56 
 
 
445 aa  245  9e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  36.34 
 
 
519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  36.06 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  38.07 
 
 
515 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  37.76 
 
 
515 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  39.8 
 
 
511 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  37.76 
 
 
519 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  37.76 
 
 
515 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  37.46 
 
 
515 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  41.56 
 
 
550 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.87 
 
 
532 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.67 
 
 
527 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.44 
 
 
517 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  38 
 
 
534 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.35 
 
 
530 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  37.46 
 
 
515 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  37.46 
 
 
515 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  37.16 
 
 
515 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.27 
 
 
528 aa  236  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  39.8 
 
 
514 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  35.42 
 
 
476 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  35.42 
 
 
476 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  37.1 
 
 
473 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  37.1 
 
 
476 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  40.66 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  33.67 
 
 
492 aa  216  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  36.06 
 
 
518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  36.73 
 
 
524 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.25 
 
 
457 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 
564 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  38.93 
 
 
507 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.8 
 
 
564 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.91 
 
 
457 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 
546 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.25 
 
 
452 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.25 
 
 
452 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.25 
 
 
452 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  33.25 
 
 
452 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 
529 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 
525 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.25 
 
 
452 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 
525 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.58 
 
 
495 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.25 
 
 
452 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 
525 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 
528 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1320  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
512 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367153  normal  0.0421613 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 
529 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  36.96 
 
 
483 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  35.9 
 
 
483 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  36.96 
 
 
483 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  35.9 
 
 
483 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  34.86 
 
 
501 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  36.1 
 
 
495 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 
561 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2292  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
458 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376038  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.18 
 
 
612 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  36.18 
 
 
612 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  34.26 
 
 
474 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 
471 aa  202  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.24 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2650  lytic transglycosylase, catalytic  37.73 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.012845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.24 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  33.91 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.83 
 
 
464 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  36.77 
 
 
570 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.38 
 
 
475 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  35.48 
 
 
531 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  35.67 
 
 
516 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  37.91 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.16 
 
 
472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  33.72 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.16 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  38.31 
 
 
516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.29 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  33.95 
 
 
474 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>