More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1168 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  100 
 
 
593 aa  1186    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  49.83 
 
 
590 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  49.49 
 
 
590 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  44.2 
 
 
593 aa  508  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  46.52 
 
 
594 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  44.3 
 
 
606 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  42.63 
 
 
591 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  43.64 
 
 
588 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  41.38 
 
 
614 aa  465  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  42.62 
 
 
605 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  43.85 
 
 
632 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  42.59 
 
 
593 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  43.1 
 
 
593 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  39.49 
 
 
590 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  42.93 
 
 
592 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  39.28 
 
 
591 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  38.97 
 
 
593 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  39.73 
 
 
588 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  39.73 
 
 
588 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  38.62 
 
 
641 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  42.14 
 
 
591 aa  422  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  39.04 
 
 
591 aa  422  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  38.94 
 
 
620 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  39 
 
 
586 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  39.35 
 
 
590 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  38.32 
 
 
590 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  38.32 
 
 
619 aa  392  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  37.09 
 
 
591 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  38.01 
 
 
587 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  36.96 
 
 
594 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.4 
 
 
588 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  36.39 
 
 
584 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.73 
 
 
597 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 
602 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 
596 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.51 
 
 
588 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 
592 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.48 
 
 
623 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.16 
 
 
622 aa  264  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.93 
 
 
613 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.89 
 
 
627 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.07 
 
 
609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 
598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.06 
 
 
611 aa  249  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.21 
 
 
612 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.73 
 
 
610 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.73 
 
 
630 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  31.69 
 
 
581 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.73 
 
 
610 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  32.11 
 
 
580 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.65 
 
 
596 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.82 
 
 
596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.53 
 
 
619 aa  244  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.62 
 
 
610 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.62 
 
 
592 aa  238  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.05 
 
 
593 aa  236  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.76 
 
 
610 aa  236  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.03 
 
 
589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  29.36 
 
 
621 aa  233  8.000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.57 
 
 
609 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.5 
 
 
609 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  25.84 
 
 
608 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  27.12 
 
 
609 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.28 
 
 
619 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.1 
 
 
610 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  31 
 
 
588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.46 
 
 
616 aa  227  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  27.89 
 
 
611 aa  226  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  28.76 
 
 
610 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.73 
 
 
620 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  28.69 
 
 
605 aa  225  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 
618 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.6 
 
 
596 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  28.76 
 
 
610 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  28.76 
 
 
610 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  28.76 
 
 
610 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.76 
 
 
610 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  28.76 
 
 
610 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.32 
 
 
610 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.52 
 
 
624 aa  223  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.02 
 
 
581 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  26.92 
 
 
588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.76 
 
 
610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  28.6 
 
 
610 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.61 
 
 
592 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.37 
 
 
592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.09 
 
 
610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.76 
 
 
607 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 
588 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.27 
 
 
608 aa  220  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  28.91 
 
 
609 aa  220  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  27.81 
 
 
613 aa  220  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  29.29 
 
 
599 aa  219  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30.47 
 
 
591 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29 
 
 
591 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  27.97 
 
 
604 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.95 
 
 
599 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.18 
 
 
610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  28.62 
 
 
618 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  27.86 
 
 
609 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>