More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0972 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  100 
 
 
434 aa  861    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  99.08 
 
 
432 aa  816    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  39.01 
 
 
430 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  38.77 
 
 
430 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  36.99 
 
 
443 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  36.99 
 
 
443 aa  266  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  33.01 
 
 
425 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  33.01 
 
 
425 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  33.65 
 
 
443 aa  226  8e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  31.31 
 
 
432 aa  210  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  31.31 
 
 
432 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  33.81 
 
 
426 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  33.41 
 
 
426 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  33.98 
 
 
439 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  31.27 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  31 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  32.12 
 
 
428 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
428 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  33.91 
 
 
437 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  33.66 
 
 
437 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.33 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  30.33 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  29.33 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  29.33 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  34.7 
 
 
384 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  30.35 
 
 
452 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  30.35 
 
 
452 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  29.2 
 
 
428 aa  166  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  28.95 
 
 
428 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.46 
 
 
423 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.46 
 
 
423 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.29 
 
 
434 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  29.06 
 
 
431 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  31.75 
 
 
431 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  30.94 
 
 
427 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  31.34 
 
 
427 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.78 
 
 
417 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  31.54 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  31.27 
 
 
366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  28.69 
 
 
451 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  26.1 
 
 
406 aa  131  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  26.23 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.64 
 
 
445 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  26 
 
 
441 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.4 
 
 
432 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  31.26 
 
 
429 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  27.17 
 
 
434 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
437 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  27.78 
 
 
411 aa  113  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.47 
 
 
410 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  23.83 
 
 
410 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.45 
 
 
434 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
441 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
424 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  26.63 
 
 
399 aa  106  6e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.81 
 
 
428 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  23.22 
 
 
434 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_002978  WD1033  permease, putative  26.34 
 
 
409 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.187473  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  24.65 
 
 
411 aa  102  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
421 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  25.63 
 
 
432 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
392 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  28.32 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  25 
 
 
418 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  28.86 
 
 
446 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
414 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  28.11 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  34.91 
 
 
461 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
446 aa  87  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
439 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  28.25 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  24.16 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  24.79 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_002978  WD0056  major facilitator family transporter  21.62 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  34.42 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  24.16 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  28.92 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  25.14 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  21.95 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  24.09 
 
 
418 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  25.29 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0838  hypothetical protein  23.37 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.0062417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  25.15 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  26.17 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  26.1 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0251  major facilitator family transporter  23.68 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.823307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  28.82 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  26.2 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.9 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>